Выполняя директивы и постановления Центрального Комитета партии и Советского правительства, местные партийные, советские и комсомольские органы развернули огромную работу: в сложных условиях быстрого продвижения врага в глубь страны они выделяли лучшие силы из коммунистов, комсомольцев и преданных Советской власти беспартийных патриотов для работы в подпольных организациях и партизанских отрядах, закладывали для партизан и подпольщиков скрытые базы с оружием, боеприпасами, продовольствием, медикаментами, организовывали специальные школы и курсы по подготовке партизанских кадров.
ЦК ВКП(б) постоянно направлял деятельность местных партийных органов по претворению в жизнь программных установок партии о развертывании народной борьбы в тылу врага. Для непосредственного руководства работой местных партийных органов по организации подполья и партизанского движения в июле 1941 г. при ЦК партии была учреждена специальная комиссия. С этой целью подобные органы образовали и партийные комитеты прифронтовых республик и областей. В январе 1942 г. при оргинструкторском отделе ЦК ВКП(б) была образована оперативная группа по руководству партийным подпольем и партизанским движением, в которую вошли и представители руководящих партийных органов прифронтовых республик. Создание этой группы было первым шагом к централизации партийного руководства народной борьбой в тылу врага.
Большую помощь партийным и советским органам прифронтовых областей в развертывании народной борьбы во вражеском тылу оказывали армейские штабы и политорганы, органы Наркомата внутренних дел. По указанию ЦК ВКП(б) в августе 1941 г. Главное политическое управление Красной Армии направило военным советам и политуправлениям фронтов директиву «О работе среди населения оккупированных областей и партийно-политическом руководстве партизанским движением». В августе — сентябре 1941 г. в политорганах фронтов и армий были образованы отделы и отделения по работе среди партизан и подпольщиков. Они занимались созданием новых партизанских отрядов и групп, обеспечением их оружием и боеприпасами, оказывали помощь партийным органам в установлении связи с подпольными организациями и партизанскими формированиями, находившимися в прифронтовой полосе. Координацию их деятельности обеспечивали созданное осенью 1941 г. при Главном политическом управлении Красной Армии Бюро военно-политической пропаганды, а затем созданный в июне 1942 г. Совет военно-политической пропаганды, который наряду с другими проблемами занимался усилением политической работы в тылу врага, и в частности изданием и распространением литературы на оккупированной советской территории.
В результате организаторской работы партийных, советских, комсомольских и военных органов к концу 1941 г. было создано и оставлено на оккупированной врагом территории страны свыше 1100 партийных и комсомольских подпольных комитетов и центров и почти 3500 партизанских отрядов и групп, которые стали основной базой для развертывания всенародной борьбы в тылу немецко-фашистских захватчиков.
Большая работа по организации и развертыванию борьбы в тылу врага была проведена на Украине. Этим важным участком работы непосредственно руководили М. А. Бурмистенко, М. С. Гречуха, Л. Р. Корниец, Д. С. Коротченко, И. Г. Лысенко, М. С. Спивак и др. В первые дни войны под их руководством были проведены кустовые совещания секретарей обкомов, горкомов и райкомов партии но вопросам перестройки работы на военный лад и организации народной борьбы в тылу врага.
Для осуществления практических мероприятий по подготовке партийного подполья и партизанских отрядов на Украине ЦК КП(б)У 30 июня 1941 г. создал специальную оперативную группу во главе с секретарем ЦК по кадрам М. С. Спиваком. Члены этой группы и другие руководящие партийные, советские и комсомольские работники республики выезжали в области, детально изучали положение на местах, оказывали практическую помощь партийным комитетам в комплектовании сети подполья, подбирали и инструктировали будущих руководителей подпольных организаций и партизанских отрядов, налаживали работу по материально-техническому обеспечению партизанских сил. Многие руководители местных партийных органов получали соответствующий инструктаж непосредственно в ЦК КП(б)У.