Сагайдачный закончил полный курс Острожского коллегиума и даже написал в свои студенческие годы полемический труд «Пояснения про унию», вызвавший такой отклик, что о нем упоминал литовский канцлер Лев Сапега в своем письме к полоцкому архиепископу Иосифу Кунцевичу.
Из Острога Сагайдачный переехал в Киев, где некоторое время работал домашним учителем у городского судьи Яна Аксака. Затем, примерно в 1601 г. он бросил свою работу и уехал в Запорожье, принял участие в Молдавском и Ливонском походах. Выдающиеся военные и организаторские способности, огромная трудоспособность выдвинули его в среде казаков. Сагайдачный стал гетманом и удерживал за собой это звание с небольшими перерывами десять лет.
Начал Сагайдачный свою деятельность в качестве руководителя реестрового казачества с реорганизации войска. Он постарался избавиться от всяких случайных элементов. Согласно его соглашению с польскими властями 1617 г. в реестр не могли записывать ремесленников, купцов и других, не имевших землю категории людей. Сагайдачный ввел в экипировку реестровых казаков ружье, требовал, чтобы каждый имел коня. Начались регулярные смотры войска и муштра. Поддерживалась строгая дисциплина, виновных наказывали вплоть до смертной казни.
В результате реформы вместо 50–60 тысяч своевольников появилось 10 000 регулярного войска. По мере надобности, Сагайдачный мог увеличить это число в четыре раза.
Понимая важность дополнительного дохода для казаков, Сагайдачный со своими реестровыми принимал активное участие в военных компаниях, которые организовывались с согласия или по поручению польского правительства. Для ведения войны с турками по распоряжению гетмана число чаек было увеличено до 300. В 1600 г. казаки ворвались в Перекоп, в 1609 г. сожгли Измаил и Килию. Под личным руководством Сагайдачного были совершены успешные походы через Черное море. В 1614 г. казаки разрушили Синоп, сожгли его цейхгауз, нанеся огромный материальный убыток. Гарнизон был почти полностью уничтожен, захвачены большие запасы оружия, корабли, освобождены десятки невольников. В начале 1615 г. на 80 чайках они напали на Константинополь, сожгли гавани Мизевны и Архюка, опустошили местность и ушли, перепугав самого султана. Турецкий флот погнался за ними, догнал у устья Дуная, но казаки бросились в атаку и сожгли корабли турок, захватив в плен их военачальника. После этого казаки Сагайдачного напали и сожгли Кафу – один из крупнейших невольничьих рынков Черноморья. Разгневанный султан приказал казнить великого визиря и других высших сановников, допустивших такое поражение.
После этих походов казацкое имя покрылось славой, о них заговорили даже в Европе и влияние казаков в Речи Посполитой резко возросло. Оно все больше превращалось в силу, с мнением которой приходилось считаться даже королю. Польский сейм неоднократно с тревогой отмечал, что казаки сами устанавливают себе законы, сами избирают командиров и практически создают в рамках Речи Посполитой иную республику.
Киевская братская школа. И. Борецкий
Понимая значение казачества для своих внешнеполитических планов, польское правительство было вынуждено пойти на некоторые уступки в религиозном вопросе. В 1607 г., на съезде под Сандомиром, православная шляхта постановила просить короля об уничтожении унии, лишении униатов епископских должностей и замещении их православными. В конституцию варшавского сейма 1607 г. была внесена особая статья «о религии греческой», в которой давалось обещание не нарушать прав в отношении к вере и не запрещать свободное отправление церковных обрядов. Этим послаблением не замедлили воспользоваться сторонники православия.
Центром борьбы против унии становится Киев. Именно там объединяются усилия гетмана Петра Сагайдачного и нового архимандрита Киево-Печерской Лавры Елесея Плетеницкого (сменившего умершего Никифора Тура). Плетеницкий купил старую типографию, переоборудовал ее и в 1616 г. выпустил первую книгу. В Киев приезжают и другие известные православные полемисты – Захарий Копыстенский, Курцевич-Булига. Вместе они организуют кружок пресвященных борцов за православие.
В 1615 году вдова мозырского маршала Гальшка Гулевич даровала на нужды «правоверным и благочестивым христианам» свои земли с усадьбой в Киеве. Там планировалось построить монастырь, гостиницу для духовных странников, а также школу для шляхетских и мещанских детей. В конце 1615 г. было создано киевское братство по подобию виленского, львовского и других. В него вступило местное духовенство, мещане и шляхта, весь кружок Плетеницкого, а также гетман Сагайдачный со всем своим войском. Первым ректором братской школы, которая начала свою работу в 1617 г., стал Иов Борецкий.