Ситуация вышла из-под контроля и в феврале 1658 г. произошло первое открытое столкновение восставших с войсками Выговского. Гетманская власть держалась на волоске. Нарастание недоверия между гетманом и царем усилилось из-за опалы патриарха Никона, пользовавшегося большим авторитетом и влиянием среди старшины и духовенства Украины.
Воспользовавшись ситуацией, царское правительство в июне 1658 г. прислало воевод во все основные украинские города, что, по сути, было нарушением Переяславского соглашения, гарантировавшего «казацкие вольности». Появление в Украине воевод вызвало резкую реакцию старшины. И. Богун выступал с открытыми угрозами в их адрес. В конечном счете, воеводы были отозваны.
Только в июне 1658 г. Г. Г. Ромодановский получил, наконец, приказ оказать поддержку Выговскому. Но было поздно – гетман уже призвал на помощь орду и в битве под Полтавой разбил войска восставших. М. Пушкарь был казнен.
Гадячский договор. Княжество Руськое.
Отчаявшись получить помощь в Москве, Выговский для спасения своей булавы пошел на договор с Польшей, попытавшись добиться условий конфедеративного союза. Любой другой союз казаки, ненавидевшие поляков, просто бы не приняли. Существование в Речи Посполитой группы магнатов, выступавших за наделение казаков равными со шляхтой правами и рядом других привилегий, делали такие планы не совсем призрачными. Например, Я. Лещинский писал Е. Любомирскому: «Даже если бы казаки требовали отдельной провинции, я бы не очень противился – лишь бы только они от нас зависели».
По сути, первая редакция Гадячского договора – в том виде, в каком он был подписан, была попыткой сохранить автономию Украинского гетманства и даже получить гарантии ее укрепления. Выговский здесь выступал как приемник политики Б. Хмельницкого и лидер государственной группировки. Одной из первых задач, которую он со своими единомышленниками ставил перед собой, было юридическое оформление гетманства как такового и закрепление его статуса. Именно тогда, в конце 50 х годов XVII в. возникла идея создания Княжества Руського. Речь шла о превращении Речи Посполитой в государство «трех народов».
Гадячский договор был заключен 16 сентября 1658 г. Соглашение включало в себя образование Княжества Руського в составе Брацлавского, Киевского и Черниговского воеводств, выпуск собственной монеты, создание сейма, уничтожение унии и предоставление широких привилегий православию, сохранение реестра в 60 тысяч человек, свободное избрание гетмана и даже – сохранение союза с Москвой. Отдельные статьи оговаривали учреждение академий, школ, библиотек и типографий.
Однако под влиянием польской шляхты и сильного давления со стороны Ватикана, сейм в мае 1659 г. принял Гадячский договор в более чем урезанном виде. Идея Княжества Руського вообще была выброшена, равно как и сохранение союза с Москвой. Отменялась ликвидация унии и ряд других позитивных статей. Решение сейма стало крахом гетманства Выговского.
Между тем началось наступление русских войск на Левобережье. Цветущий край был опустошен «огнем и мечом». Кровавые бои между русскими и украинцами продолжались до февраля 1659 г., когда боярину и наместнику А. Н. Трубецкому был дан тайный наказ начать переговоры с Выговским, предлагая условия Гадячского договора. Однако русские воеводы предпочитали переговорам с несговорчивым гетманом войну. Они дали вождю радикальных элементов запорожскому кошевому атаману И. Беспалому титул гетмана Войска Запорожского, начав тем самым эпоху «многогетманства». Казаки Беспалого грабили и своевольничали, не подчиняясь приказам русских. Сторонники Выговского были осаждены в Конотопе, где 70 дней отражали все штурмы. На выручку к ним отправился сам гетман с казаками и союзными татарами. Битва произошла 8 июля 1659 г. под Конотопом. Выговский атаковал русские войска, а затем спешно отступил, имитируя панику. Татары и казаки, сидевшие в засаде, ударили в тыл русским. Казаки перекопали дорогу, разобрали мост и отрезали таким образом все пути к отступлению. А. Н. Трубецкой понес серьезные потери убитыми, ранеными, многие попали в плен.
Свержение И. Выговского. Переяславская рада 1659 г.
Однако победа не спасла Выговского. Перед лицом возможных массовых выступлений против Гадячского договора, Левобережная старшина предпочла искать соглашения с московскими воеводами. Т. Цицура и В. Золоторенко практически сдали все Левобережье воеводам Г. Г. Ромодановскому и А. Н. Трубецкому, претендуя в награду за это на гетманскую булаву. В этих условиях Правобережная старшина принесла Выговского в жертву. Его лишили булавы на генеральной раде 23 сентября 1659 г., и новым гетманом избрали сына любимого в народе «батьки» Хмельницкого – Юрия. Этим был предотвращен раскол гетманства, т. к. лидеры Левобережья и русские воеводы предпочли искать с ними соглашения, чем начинать новую тяжелую войну.