Положение Дорошенко, который не предпринимал и не был в состоянии что-либо предпринять для защиты Правобережья, становилось безнадежным. Его покидала старшина и казаки. Правобережье все более пустело, жители спасались бегством. Символом приближавшегося конца стала смерть в августе 1675 г. соратника Дорошенко киевского митрополита Иосифа Тукальского.
Наконец осенью 1676 г. Самойлович с Ромодановским предприняли очередной поход на Правобережье. Когда они подошли к Чигирину, не желая более продолжать кровопролитие, Дорошенко вышел из города в сопровождении старшины и духовенства и сложил клейноды (знаки своей гетманской власти).
Так закончилась политическая карьера Петра Дорошенко. Он был отправлен в Москву, где некоторое время жил на положении почетного пленника. Затем его назначили воеводой в Вятку. Окончил свои дни Дорошенко в 1698 г. в своем имении в Ярополче, Волоколамского уезда. Праправнучкой гетмана была Наталья Гончарова, супруга А. С. Пушкина.
Чигиринские походы
Устранение с политической сцены Дорошенко совпало с большими политическими изменениями в Московском государстве. 30 января 1676 г. умер царь Алексей Михайлович и на престол вступил его слабый и болезненный сын Федор Алексеевич. Начало периода боярских заговоров и интриг, ослабление центральной власти не могли не сказаться на Украинском гетманстве. Меняется и политика Московского государства по отношению к Украине. На первый план снова выходит союз с Речью Посполитой.
Между тем Турция не желала отказываться от притязаний на украинские территории. Султан Магомет IV назначил новым гетманом Юрия Хмельницкого, который с 1672 г. содержался в турецком заключении. Султан приказал Константинопольскому патриарху снять с него монашество и пожаловал его титулом «князя малороссийской Украины». Именно тогда, если верить некоторым источникам, Сирко написал знаменитое письмо – турецкому султану Мухаммеду IV, в ответ на его предложение принять турецкое подданство. Правда, по своей стилистике оно было гораздо сдержанней своего фольклорного варианта. В конце июля 1677 г. двинул к Чигирину армию Ибрагим-паши вместе с Юрием Хмельницким.
4 августа турки подошли к Чигирину, в котором с момента капитуляции Дорошенко находился московский гарнизон, осадил его и потребовал сдачи, но получил отказ. На помощь городу из-за Днепра двинулись Самойлович и Ромодановский. Узнав о их приближении, турки, сняв осаду, ушли, потеряв около 10 тысяч человек.
На следующий год они повторили свою попытку. В преддверии ожидаемого похода, Феодор Алексеевич приказал укрепить город и снабдить его запасами. Во время осады взрыв турецких мин привел к пожару в нижнем городе. Одновременно с этим неприятелю удалось зажечь и новый верхний город. Оставшийся гарнизон отступил в старый верхний город и там весь день отбивал штурмы противника.
Ночью, по приказанию Ромодановского, была зажжена уцелевшая часть Чигирина, а замок был взорван порохом. Это решение Ромодановского по-разному оценивалось как современниками, так и историками. Во время стрелецкого бунта 1682 г. Г. Г. Ромодановский был обвинен в измене за сдачу Чигирина и растерзан.
Правобережье под властью турок и поляков
Противодействуя стремлению Юрия Хмельницкого заселить опустошенное Правобережье, Самойлович решил уничтожить все уцелевшие крепости другого берега, а их жителей перевести в Слободскую Украину, с тем, чтобы она тоже была передана в гетманское правление. В результате, весной 1679 г. силами Левобережных полков было организовано переселение 20 тысяч семей из приднепровских городов (Канева, Корсуни и других), вошедшее в историю как «великий сгон». Правда после этого Слободскую Украину так и не отдали в управление гетману.
Юрий Хмельницкий, с татарами некоторое время оставался на правом берегу Днепра. Он занял Немиров, Корсунь и другие города и не раз осенью и зимой нападал на левобережные города. Но надежды турок, что имя Хмельницкого привлечет к нему казаков, не оправдались, и в 1685 г. он был убит по приказу султана.
Между Турцией и Россией начались переговоры. Самойлович был сторонником мира с Турцией, но настаивал на том, чтобы оставить за гетманством земли между Днепром и Днестром, по крайней мере – до Южного Буга. Но крымский хан выступил решительным противником этой идеи. В конечном счете, московское правительство согласилось признать границей Днепр, с тем, чтобы территория между Днепром и Южным Бугом оставалась незаселенной буферной зоной. При этом Запорожье переходило под управление царя. Именно на этих условиях был утвержден Бахчисарайский мир.