После упадка школы в Салерно в конце XIII века на первый план выдвинулись медицинские школы в Монпелье, Болонье, Падуе и Париже. В целом, в средние века к медицинскому знанию было прибавлено очень немногое.
Только в XIII веке у немногих представителей медицины замечается поворот и обнаруживается стремление изучать природу путём наблюдений и опытов. Таковы Арнольд из Виллановы и Р. Бэкон.
В XIV веке начинается разработка анатомии на основании вскрытий. М. де Луцци (1275–1326 годы) издаёт сочинение, содержащее точные изображения органов. До XV века арабы царили в европейской медицине, так что даже сочинения Галена в Европе распространялись в переводах с арабского.
Первые больницы при христианских церквях появились после Никейского собора как знак милосердия к беднякам. Много веков подряд страждущие под любыми предлогами старались избегнуть храмов медицины — из-за антисанитарии и невежества врачей смертность там поражала воображение.
Немногим лучше обстояли дела в монастырских богадельнях и приютах для паломников. Орден святого Иоанна организовал госпиталь в Палестине в 1080 году, монахи, ухаживающие за страдальцами, носили кресты на одежде и верхом выезжали на поле битвы, чтобы подобрать раненых. Считается, что именно иоанниты стали первыми парамедиками скорой помощи.
Когда в XIV веке в Европу пришла чума, городам волей-неволей пришлось заняться здравоохранением. Служители-мортусы крючьями стаскивали с улиц бренные тела, а заболевших на телегах отвозили в чумные бараки.
Астрология управляла прогностикой; диагнозы ставились преимущественно на основе осмотра мочи. Терапия вернулась к магии и молитвам, фантастическим, часто отвратительным снадобьям, заклинаниям, амулетам и религиозному целительству. Широко применялись кровопускание и различные травы. Вскрытие трупов было полностью запрещено, и сведения по анатомии, помимо книг, можно было почерпнуть лишь при разделывании свиней. Корень мандрагоры, о котором ходило множество легенд, считался наилучшим средством. Гигиена и санитария оставались на очень низком уровне, поскольку презиралось само человеческое тело.
Позднее средневековье
В средние века существовали врачи. Настоящие врачи — доктора медицины, получившие университетское образование. Люди весьма гордые, богатые, знатные, нередко посвящённые в рыцари. Врач Средних веков кое-что умел, но лечить он не мог. Самым страшным было то, что сам врач этого не знал. Он пытался чинить механизм, об устройстве которого понятия не имел. Так, кровопускания, казалось, приносят быстрое и гарантированное облегчение: мечущийся в бреду больной успокаивается и засыпает. Но на самом деле они лишь ослабляли организм, облегчая и ускоряя переход пациента в лучший мир. Пропагандируя кровопускания как общеполезную гигиеническую процедуру, врачи наносили большой вред.
Даже в XVI веке Парацельс считал эффективными средствами лечения молитвы, заговоры и гороскопы, подсказывающие, в каком именно металле нуждается организм больного. Некоторым не везло: выпадала ртуть.
Самым же слабым местом средневековой хирургии было неумение врачей предотвращать проникновение инфекции в рану. Разрез промывался только от видимой грязи и только вином, которое, в отличие от водки, заразу уничтожить не способно. Ничего не зная о микроорганизмах, врачи перед операцией даже не мыли рук.
Период Возрождения
Начался в XIV веке и продолжался почти 200 лет. Он был одним из самых революционных и плодотворных в истории человечества.
В родственных медицине дисциплинах, физиологии и анатомии, составляющих основу научной медицины, произошли поистине грандиозные изменения.
Гуманизм эпохи Возрождения проявляется развитием клинического метода в медицине, щадящей хирургией, обращение к человеку.
В странах Западной Европы начали открываться светские школы. К XV веку в Европе было уже свыше 40 университетов, в большинстве которых имелись медицинские факультеты. Центром гуманистических идей и нарождающейся новой науки в XV–XVI веках стал Падуанский университет; новые идеи были частично восприняты и другими итальянскими университетами. Тем не менее, ведущими источниками в преподавании на медицинских факультетах продолжали оставаться канонизированные тексты Галена, Рази, Ибн Сины.
В 1456 году выходит первая медицинская печатная книга.
В XVI веке в Тюбингенском университете для анатомирования получали не более одного трупа в год, в Гельмштадском — два, в Лейденском — четыре. Известный врач, профессор Базельского университета Ф. Платтер вспоминал, что в годы обучения в Монпелье в 1552–1557 годах он вместе с другими студентами «добывал» трупы для анатомирования, раскапывая ночами свежие могилы. В 1594 году в Падуанском университете был построен первый анатомический театр.