И, наконец, третий уровень включает в себя различные финансовые, политические и идеологические учреждения, также создаваемые людьми "Опус Деи", но не связанные с орденом на религиозном уровне. К ним относятся личные фонды, работающие на международном уровне и связанные с банками и промышленными предприятиями, политические клубы и семейные ассоциации. Эти учреждения, создаваемые и в тех странах, где "Опус Деи" не имеет своего представительства, настолько скрытно внедрены в структуру ордена, что их очень трудно распознать. Руководители этих организаций действуют как частные лица, и орден не несет никакой ответственности за их действия. Так что когда "Опус Деи" утверждает, что он служит лишь духовным целям, то с формально-юридической точки зрения это так, хотя на практике дело обстоит иначе". Данная система позволяет ордену проникать в различные сферы и вовлекать в свою деятельность широкий круг людей. По данным самого ордена, в настоящее время если число его членов достигает более 88 тысяч, то в деятельности связанных с ним организаций участвует около 900 тысяч человек.
Уникальная религиозная и организационная дисциплина ордена и его методы "мобилизации" мирян сделали его незаменимым в условиях перехода церкви к "новой евангелизации" в целях преодоления того состояния глубокого внутреннего разъединения и брожения, в котором оказалась церковь в результате либеральных реформ II Ватиканского собора. Речь шла о том, чтобы обеспечить наличие твердого католического ядра, которое гарантировало бы сохранение системы папской власти и ее связей с элитой западного общества в условиях расширяющейся экуменической открытости церкви.
Что касается отношения самого Эскрива к решениям собора, то оно было сугубо положительным. В апреле 1967 г. в интервью нью-йоркскому "Time" он отмечал: "Мы рады услышать, что собор торжественно заявил, что церковь не отметает тот мир, в котором она живет, ни его прогресс, ни его развитие, но что она его понимает и любит". "Что меня также в большой степени порадовало, так это то, что II Ватиканский собор совершенно ясно заявил о божественном призвании мирян. Без всяких претензий я хотел бы сказать, что собор ... подтвердил то, что с Божьей милостью мы практикуем и преподаем в течение стольких лет...". Эскрива не только не препятствовал формально работе Ватикана, но с его ведома и при его поддержке два священника ордена - Портильо и Эрранс - работали в комиссии собора По подготовке документов (Портильо был секретарем подготовительной комиссии по делам мирян и консультантом в некоторых других комиссиях).
Большинство членов "Опус Деи" настойчиво утверждают, что Эскрива опередил "аджорнаменто" и "всеобщий призыв к святости", заявив, что святость не является прерогативой религиозной элиты еще за несколько десятилетий до того, как собор сформулировал это в качестве религиозной доктрины. Эту же мысль высказал и папа Иоанн Павел II, заявив в своем приветственном обращении к студентам в августе 1979 г., что откровение Эскрива "предвосхитило ту теологию мирян, которая характеризовала церковь во время проведения собора и в постсоборный период". Последователи Лефевра в связи с этим позже напишут: "Это не столько "Опус Деи" продолжает дело II Ватиканского собора, сколько наоборот". Еще более красноречиво оценил роль Эскрива не очень благоволивший ему кардинал Джованни Бенелли, правая рука Павла VI, заявивший: "Чем Игнатий Лойола был для собора в Тренте, тем же Хосемария Эскрива был для последнего экуменического собора. Он был рожден для того, чтобы постановления Второго Ватиканского собора стали неотъемлемой частью церковной жизни".
С энтузиазмом восприняв послание собора, Эскрива вместе с тем негативно отнесся к тем вольным интерпретациям, которые, как он считал, извратили принятые решения и восприняли их как возможность разрыва с традицией, что положило начало "периоду безумия". Именно за отказ воспринимать решения собора как право на разрыв с традицией, а никак не в силу его антиреформаторской позиции членов "Опус Деи" в прессе стали называть "консерваторами". Однако Эскрива признавался немецкому кардиналу Иозефу Хеффнеру: "Все это меня не пугает. Так же, как и кризис идентичности, который поразил священников и религиозных людей... Господь и Святой Дух живут и действуют в церкви". Именно свой орден Эскрива рассматривал как настоящую церковь, реально воплощавшую соборные решения и сохранявшую верность католицизму и папе.