Между Кеннеди и Джонсоном никаких разногласий вообще не возникало. В главных вопросах внутренней политики, таких как борьба с расовой дискриминацией и проведение социально-ориентированных реформ, направленных на создание «Великого общества», где не будет бедных, они были едины. Джонсон продолжал и углублял линию Кеннеди в этих вопросах. И сам термин «Великое общество» был введен в обращение уже в президентство Джонсона. Что же касается внешней политики, то здесь Джонсон пошел на дальнейшую эскалацию американской военной интервенции во Вьетнаме. Но в ноябре 1963 года невозможно было сказать, пойдет ли Кеннеди во Вьетнаме так же далеко, как Джонсон. Точно так же и сам Джонсон в тот момент вряд ли имел ясное представление, как следует действовать во Вьетнаме. Принципиально замена Кеннеди на Джонсона никому не могла привести очевидных выгод, и как возможный мотив убийства Кеннеди ее рассматривать как-то странно.
Иногда в кандидаты на пост главы заговора против президента Кеннеди выдвигают главу ФБР Эдгара Гувера. Дескать, Кеннеди шантажировал Гувера сведениями о его гомосексуализме и грозился отправить в отставку. Что ж, слухи о гомосексуализме Гувера ходили давно, поскольку он был известен как убежденный холостяк, утверждавший, что всю свою жизнь без остатка отдает работе в Федеральном бюро расследований. Заместителя Гувера Клайда Толсона, с которым тот не расставался почти все служебное время и вместе с которым обедал и ужинал, подозревали в том, что он – любовник своего шефа, тем более, что все свое состояние Гувер завещал Толсону. Однако если даже слухи о гомосексуализме Гувера соответствуют истине, глава ФБР был слишком опытным полицейским и никаких улик на сей счет современникам и потомкам не оставил. А если Кеннеди вдруг решил уволить его с должности, Гуверу не было никакого смысла убивать президента. Ему достаточно было бы только обнародовать данные о том, что любовница Кеннеди одновременно является любовницей главаря чикагской мафии, и политическая карьера президента рухнула бы окончательно и бесповоротно. Тут никакие миллионы клана Кеннеди не помогли бы.