Примерно с середины XVII века дзю-дзютсу начинают изучать в школах самураев. Буси-до — священный кодекс поведения самураев, предписывал им обязательное владение техникой кэн-дзютсу (фехтование на мечах), кю-дзютсу (стрельба из лука), нагината-дзютсу (владение копьём) и дзю-дзютсу.
В это же время происходило развитие стилей дзю-дзютсу (всего же существует около 200 стилей) вместе с развитием методов китайской медицины как для поражения противника, так и для лечения. Приемы поражения жизненно важных центров ревностно хранились и культивировались лишь в узком кругу фамильных мастеров и потомков самурайских родов, а методы лечения были широко известны.
Существует предание, что в 1795 г. в Эдо (старое название Токио) Микадо пожелал познакомиться с самыми пожилыми людьми Страны Восходящего Солнца. К нему прибыл один из старейших людей Японии — крестьянин Мампэ, которому в то время исполнилось 194 года. Вместе со стариком пришли 173-летняя жена, сын в возрасте 153-х лет, невестка в возрасте 145 лети внук в возрасте 105 лет. Почти через полвека, когда страной правил другой микадо, на торжество по случаю открытия моста в Эдо были приглашены долгожители. Среди почетных гостей вновь оказался теперь уже242-летний старик Мампе со своей семьёй. Когда старейшину семьи спросили, в чем секрет его долголетия, он ответил: «У своих предков я научился мокуса и пользуюсь им всю жизнь. Я и моя семья через каждые четыре дня прижигаем точку «от ста болезней». (Аси-сан-ри, Е36 —
Широкое внедрение китайских методов лечения продолжалось до 1883 года — периода проникновения в Японию и «покорения» её западной медициной. Но и после значительной реорганизации здравоохранения и подготовки медицинских кадров на основе европейской медицины иглотерапия продолжает занимать видное место в японской медицине. Развились и существуют поныне школы обучения искусству иглоукалывания, прижигания и точечного массажа с 4-годичными курсами.
Нин-дзютсу (
Традиция нин-дзютсу, берущая начало в VI–VII вв. после внедрения буддизма в Японии, в частости школ Сингон (Истинное слово), Дзен (Молчаливое самоуглубление), Тэн дай (Величие небес) и вместе с ними эзотерической китайской системы Люгаймэнь (Врата учения нищих монахов) — своеобразной системой подготовки сверхчеловека, обученного владению всеми видами оружия, методами составления лекарств и ядов, школой маскировки, гипноза и другим премудростям этой поистине «школы выживания». Сначала, на основе Люгаймэнь, тантрического буддизма и местных японских культов была создана система Сюгэндо (путь овладения сверхъестественными силами) монахом Эн-но Одзуно (Эн-но Сёкаку, 634–703 гг.). Данная система распространилась по Японии с помощью монахов Ямабуси (Спящие в горах) и Яма-но Хидзири (Горные мудрецы), которые были учителями, а иногда и предводителями таинственных кланов нин-дзютсу.
Воин-ниндзя — тренированный с детства cyпервоин-суперпшион, отлично владевший методами рукопашного боя, боя с любым видом оружия, владевший методами маскировки, любых видов шпионажа, непревзойдённый артист, мастер боевых искусств, с необычайно натренированным телом, границы возможностей которого значительно отличались от обычного человека.