Православная церковь в XIX — начале ХХ в. имела сотни церковно-приходских школ, которые в основном финансировались государством. У евреев были свои школы, так почему Армянской церкви не иметь свои ЦПШ?
16 февраля 1884 г. император Александр III утвердил Правила об армяно-григорианских церковных училищах на Кавказе. Они расширяли контрольные функции правительственной власти. Так, попечительство Кавказского учебного округа получало право наблюдения за преподаванием всех предметов, исключая Закон Божий, а также требовать удаления тех учителей, которые оказались несоответствующими своему званию. Правила 1884 г. однозначно определили вопрос о том, какие учебные заведения изымаются из ведения армяно-григорианского духовенства. Это были церковные училища, которые по своему курсу выходили за пределы элементарной (начальной) школы и по составу имели более двух классов. Они переходили под надзор училищного начальства, на общем с частными учебными заведениями основании.
23 мая 1885 г. министр внутренних дел Д.А. Толстой представил императору обширный доклад о ходе закрытия армянских церковно-приходских школ. В нем сообщалось, что главноначальствующим гражданской частью на Кавказе уже закрыто 169 школ.
В 1891 г. на судебном процессе над священником Тер-Воскаковым выяснилось, что в армянском богослужении нет молитвы за русского царя.
На состоявшемся 3 мая 1897 г. заседании Государственного совета было принято мнение о подчинении всех армяно-григорианских церковных училищ, кроме Духовной академии и семинарий, Министерству народного просвещения. 2 июня Николай II утвердил это мнение Государственного совета. Суть решения состояла в следующем: 1) состоящие при армяно-григорианских церквях и монастырях училища подчинить ведению Министерства народного просвещения, на общем основании с другими начальными училищами, находящимися в заведывании сего министерства, с тем, чтобы при новом порядке управления сохранено было право армяно-григорианского духовенства наблюдать за религиозным образованием юношества в означенных заведениях.
Главноначальствующий гражданскими делами на Кавказе Г.С. Голицын во всеподданнейшей записке за 1897 г. указывал, что в 1896 — начале 1897 г. было закрыто 230 школ, а действующих осталось 31.
Естественно, что армянское духовенство противодействовало этим мерам, доказывая, что имущество это принадлежит церквям и монастырям на праве собственности.
По проекту Г.С. Голицына 12 июня 1903 г. был принят закон о секуляризации имущества Армяно-григорианской церкви.
Поражение России в войне с Японией спровоцировало революционные выступления по всей России, как в песне — «от Кронштадта до Владивостока». С мая 1905 г. в Закавказье начались столкновения татар и армян.
Наиболее жестокие столкновения имели место в Баку в феврале и августе и в Нахичевани в мае 1905 г. По данным американского тюрколога-азербайджановеда Тадеуша Свентоховского, в ходе столкновений 1905 г. было разрушено около 158 азербайджанских и 128 армянских поселений и погибло, по разным оценкам, от 3 до 10 тысяч человек.
Волнения рабочих в Петербурге 9 января 1905 г. отозвались в других крупных промышленных центрах России. Волна распространилась и на кавказские города, включая Тифлис, Батум и Баку. Начавшиеся в Баку митинги и забастовки рабочих закончились поджогом ряда нефтяных скважин. Эти события сопровождались антиармянской агитацией в среде азербайджанских тюрок.
6 февраля 1905 г. на Парапете около армянской церкви произошел инцидент. Тюрок по фамилии Бабаев выстрелом из пистолета ранил армянского солдата-конвоира. Армяне сдали Бабаева в полицию и потребовали обыскать его, однако тот оказал сопротивление и, стреляя из пистолета, выскочил из полицейской кареты. Возле улицы Кривая разъярённая толпа прикончила его. Единоверцы положили тело Бабаева на повозку и повезли по тюркским кварталам, возбуждая тюрское население против армян.
Приехавшая из Тифлиса в Баку француженка Жозефин Кубли свидетельствует: «…Сын хозяина нашего дома, молодой тюрок, с пистолетом в руке вошёл в комнату. На вопрос о том, что происходит, ответил, что ни они, ни армяне не виноваты в погромах. Им приказали убивать армян, и они в течение трёх дней будут это делать».
Сразу же за сигналом о начале погромов последовали зверские убийства армян. Только в этот день было убито и ранено около 35 армян. 7 февраля погромы возобновились и продолжались три дня и три ночи.