В связи с упразд нением Кузне цкой кр епости и выводом из нее войск, в начале 1840-х гг. из местной городской тюрьмы в пустующее помещение солдатской казармы были переведены заключенные.
С середины 1860-х гг. все крепостные строения (кроме тюремного острога и госпиталя) перепроданы «в частные руки на слом купцу Ивановскому». В 1870 г., на основе перестроенных развалин каменной солдатской казармы, в крепости была образована Кузнецкая тюрьма Томской губернии для уголовных преступников – Кузнецкий тюремный замок. В тюрьме содержалось от 80 до 160 заключенных.
Здание тюрьмы обнесли бревенчатым частоколом. Для нужд тюрьмы дополнительно построили: баню, склады, караульную. При тюрьме имелся собственный огород.
В Кузнецкой тюрьме работал лазарет на 10 коек, оставшийся от Кузнецкой крепости. До 1908 г. он был еще и единственной больницей в городе.
В 1872 г. при активном участии Попечительного комитета началась перестройка Барнаульских ворот под надвратную церковь. Надвратную башню разобрали до сводов и на ее стенах построили храм. Он был освящен 20 июня 1876 г. во имя Св. Ильи Пророка.
Кузнецкий тюремный замок существовал до декабря 1919 г., когда солдаты кузнецкого гарнизона подняли антиколчаковское восстание. Больше недели город подвергался разграблению, в котором принимали участие спешившие «на помощь восставшим» партизанские отряды. Во время беспорядков заключенных выпустили из тюрьмы, а тюремные строения сожгли.
После погрома 1919 г. крепость была бесхозной несколько десятилетий. В 1991 г. ее передали вновь созданному историко-архитектурному музею «Кузнецкая крепость».
Торжественное освящение состоялось 5 августа 1835 г. В общей сложности строительство собора продолжалось 43 года. 17 декабря 1837 г. на колокольню подняли колокол, отлитый в Вятской губернии. В 1839 г. в алтаре был сделан пол из чугуна Гурьевского завода.
Архитектура Спасо-Преображенского собора тяготеет к классицизму, хотя некоторые элементы декора можно отнести к стилю барокко. Толщина стен храма 1,5 м, а в месте примыкания трапезной и колокольни доходит до 2 м. Длина церкви 43 м. Высота от пола до центральной луковицы храма составляет 35 м, а колокольни – 40 м.
Во время антиколчаковских выступлений в декабре 1919 г. Спасо-Преображенский собор подожгли. Колокола с колокольни рухнули на землю. Остался только пустующий остов. В 1926 г. первый этаж, пострадавший от пожара, привели в относительный порядок, и в нем возобновилась служба. Но продолжалась она недолго. В 1929 г. в помещении закрытой уже церкви разместили геологический музей. Затем в здании церкви размещалась школа комбайнеров, а в конце 1930-х гг. – хлебопекарня.
Во 2-й пол. 1980-х гг. на заброшенный храм обратили внимание. В 1989 г. городской Совет передал здание собора верующим. Весной 1994 г. вокруг начался ремонт стен. В 1997 г. купола церкви и колокольни покрыли медью и позолотой. На первом этаже уложили мраморный пол с подогревом. На Кузнецком металлургическом комбинате были изготовлены кресты на купола. В 1999 г. были закончены отделочные работы. В настоящее время завершаются работы по росписи стен храма.
пл. Советов.