Потеря пациентки потрясла Блэка и, похоже, сказалась на его отношениях с коллегами. Это происшествие стало последней каплей в долгих разногласиях с его бывшим наставником доктором Джоабом А. Холасом.
Неудача возмущала Блэка, и, по не вполне выясненным причинам, в смерти девочки он винил Холаса и всех сотрудников Палаты С. Возможно, Блэк также испытывал проблемы личного характера. Он часто писал о ночных кошмарах и нервозности. И то и другое могло способствовать разрушению его профессиональных взаимоотношений.
Осенью 1874 года Блэку снова пришлось терзаться болью утраты. Только на этот раз она пришла к нему домой. Его жена Элиза родила еще одного ребенка, девочку. Элизабет трагически умерла всего через несколько дней из-за отказа каких-то внутренних органов. Судя по всему, смерть дочери привела Блэка в отчаяние. Он был безутешен.
Все же он продолжал свою работу в Палате С. На протяжении последующих четырех лет, с 1874 по 1878 год, Блэк постоянно доказывал свою незаменимость и внес неоценимый вклад в разработку операций по вивисекции, трансплантации и в коррекционную хирургию. Эти достижения подняли репутацию академии на небывалую высоту.
Зимой 1876 года Элиза родила еще одного ребенка, Виктора, но в дневниках Блэка о рождении мальчика почти не упоминается. Врач, которому уже исполнилось двадцать пять лет, очень изменился. Некогда энергичный молодой человек стал угрюмым циником. Многие считали, что эксцентричное и сумасбродное поведение Спенсера превратило его в очень трудного в общении человека. Его настроения были непостоянны и переменчивы. Малейшее несогласие с его мнением выводило его из себя. Сила убеждений, прославившая Блэка всего несколько лет назад, теперь работала против него. Под ударом оказалась не только его репутация в академии. Опасность угрожала и его благосостоянию. Тем не менее его преданность работе оставалась непоколебимой. Он был так погружен в нее, что начал пренебрегать друзьями, семьей и профессиональными обязанностями перед академией.