В инквизицию поступили доносы на Галилея, обвинявшие его в том, что он доказывает движение Земли и неподвижность Солнца. Инквизиция запросила у своих цензоров заключение по двум основным положениям теории Коперника, которые защищал и развивал Галилей. На вопрос о неподвижности Солнца цензоры единодушно ответили, что это утверждение "глупо и абсурдно в философском и еретично в формальном отношении"; столь же единодушно цензоры-богословы отвергли и мысль о движении Земли. Заключение это подписано 24 февраля 1616 г.
Незадолго до этого Галилей писал: "Запретить Коперника теперь, после того, как в многочисленных наблюдениях и в исследованиях его труда учеными со дня на день все больше раскрывается истинность его утверждений и все более укрепляется его доктрина; запретить его после того, как его допускали в течение нескольких лет...- это было бы преступлением против истины".
5 марта 1616 г. учение Коперника как "ложное и целиком противное священному писанию" было запрещено, а его трактат попал в Индекс запрещенных книг "впредь до исправления".
Однако, учитывая огромное влияние Галилея, инквизиторы решили достигнуть с Галилеем соглашения. В декрете от 5 марта не упомянуто имя Галилея, в перечне задержанных и осужденных книг нет ни его "Звездного вестника", ни "Писем о солнечных пятнах".
Галилей был вызван к кардиналу Беллармино для "увещевания" - чтобы он впредь, по крайней мере публично, не выступал с защитой гелиоцентрической системы мира. Беллармино выдал ученому свидетельство, где говорилось, что. Галилею объявлено постановление - "учение Коперника противно священному писанию и его нельзя ни защищать, ни придерживаться".
И снова в защиту Галилея выступил Т. Кампанелла. Долгие годы он находился в заточении, коменданты тюрем в Неаполе получали приказ: "принять меры, чтобы Томмазо Кампанелла был лишен всякой возможности писать". Но осужденному "еретику" удавалось писать. Он написал "Апологию Галилея".
В 1622 г. один из учеников Кампанеллы напечатал во Франк-фурте-на-Майне "Апологию". Инквизиция немедленно запретила книгу, а ее автор попал в еще более ужасные условия. Его бросили в подземелье. Кромешная тьма, грязь, вода, хлюпающая под ногами, цепи - такова плата за "Апологию". (Заметим, что в мире сохранилось несколько первых печатных экземпляров "Апологии Галилея". Один из них хранится в фондах Публичной библиотеки им. М. Е. Салтыкова-Щедрина. Этот редкий экземпляр принадлежал польскому астроному XVII в. Яну Гевелию, им собственноручно сделана на нем надпись).
Галилей, несмотря на запрещение гелиоцентрической системы, решился на смелый шаг - завершить свое большое сочинение, обещанное еще в "Звездном вестнике" и в некоторых письмах. 7 мая 1610 г. он говорил о своем стремлении "довести до конца" книгу "О системе мира". Со временем возникла и форма труда - диалог. Одному из друзей он писал: "Пока что я продвигаю вперед мой "Диалог о приливах и отливах", а вместе с тем продвигается и коперниканская система". Морские приливы и отливы Галилей считал неопровержимым доказательством движения Земли.
Друзья Галилея и даже секретарь папы Чиамполи торопили ученого закончить начатый труд.
В 1624 г. ученый дал краткий эскиз "Диалога..." в знаменитом послании к Ф. Инголи, ученому-богослову из Равенны.
Любопытно рассуждение автора о том, почему он решился на этот ответ. (Рассуждение это повторено и в предисловии к "Диалогу...") "Учение Коперника,- говорит Галилей,- теперь под запретом в Италии и в странах католицизма; но пусть не думают иные, что это произошло лишь потому, что в Риме не в состоянии понять доктрину Коперника; нет, эрудиция и таланты живы в Италии. Итальянский ученый не может оставлять без ответа невежественные утверждения, выдаваемые за научные опровержения Коперника".
Еще несколько лет напряженного труда, и книга завершена. В письме Галилея от 24 декабря 1629 г. говорится: "Я довел почти до пристани мой "Диалог" и раскрыл весьма явственно многое, что мне казалось почти необъяснимым".
Теперь надо было добиться разрешения опубликовать грандиозный труд плод раздумий автора в течение трех десятилетий. Труд, где отстаивалась убедительно и доказательно правота воззрений Коперника. Галилею пришлось приложить немало сил, выдержки, мудрости и хитрости, чтобы усыпить бдительность властей. Достаточно сказать, что на книге - пять разрешений (два из них получены в Риме, три - во Флоренции).