Нацисты были не первыми, кто запретил масонство в XX веке. Оно подвергалось нападкам большинства зародившихся в межвоенные годы тоталитарных режимов. В Италии Муссолини объявил масонов врагами фашизма и впоследствии запретил деятельность лож; то же самое произошло в Советском Союзе и в Испании при режиме Франко. В нацистской Германии Рейнхард Гейдрих основал в РСХА специальный отдел по делам масонов. Регистрировать немецких масонов вызвался Адольф Эйхман. Сложно оценить, сколько немецких масонов пало жертвами нацистского преследования, поскольку многих членов лож арестовали и отправили в концентрационные лагеря из-за политической деятельности.
Масонство было важным компонентом пропаганды, направленной как против внешних, так и против внутренних врагов. В немецкой пропаганде часто упоминалось, что масонами были и Уинстон Черчилль, и Франклин Рузвельт. Когда немецкий фельдмаршал Фридрих Паулюс вопреки приказу Гитлера капитулировал при Сталинграде, в немецкой пропаганде его назвали «масоном самого высшего ранга». При этом нацисты старались не упоминать, что масонами также были Гёте, Моцарт и Фридрих Великий.
Летом 1940 года ЭРР в Амстердаме составил карту масонских лож Нидерландов. В списке оказались тридцать одна масонская ложа и десять лож «Право человека», членами которых могли становиться как мужчины, так и женщины. Также в список попали тридцать одно местное отделение ордена «Странные братья» и пятнадцать ротари-клубов. В начале сентября ЭРР начал проводить организованные рейды, важнейшей целью которых был Великий восток Нидерландов в Гааге. Этот орден не только славился своей библиотекой, но и функционировал в качестве вышестоящей организации для длинного списка региональных лож, в которых состояло более четырех тысяч членов. «Четвертого сентября 1940 года всех членов собрали в ложе, велев принести из дома все регалии. Дома тех, кто отказался подчиниться, подверглись обыску», — сказал мне Пипенброк. Всех масонов зарегистрировали, после чего ложи были распущены. Большинство членов отпустили, но великого магистра Великого востока Нидерландов Германнуса ван Тонгерена арестовали и отправили в концлагерь Заксенхаузен, где он и умер.
Вся собственность лож была конфискована, конфискации подверглись здания, регалии и библиотеки. Как и в Германии, многие масонские ложи переоборудовали в штабы, склады и координационные центры различных нацистских организаций.
Из Германии также пришла идея проведения «порочащих выставок», которые использовались оккупантами в попытке завоевать симпатии местного населения в борьбе против масонов, евреев и большевиков. В Париже антимасонская выставка открылась в июне 1940 года, а через год подобное мероприятие прошло и в Брюсселе.
Во Франции ЭРР начал подготовку к разграблению масонских лож раньше, чем в Нидерландах. Не дожидаясь окончания военных действий, Альфред Розенберг отправил сотрудников во Францию, чтобы провести разведку перед будущими рейдами. Восемнадцатого июня 1940 года один из его посланцев, профессор Георг Эберт, сообщил, что занял здание крупнейшей во Франции масонской ложи Великий восток Франции на Рю-Каде в Париже.
Во Франции и Бельгии ложи были разграблены столь же тщательно, как и в Нидерландах. Рейды также были организованы в Бельгии, Норвегии, Польше, Австрии, Греции и на Балканах.
ЭРР и РСХА вели ожесточенную борьбу за право заполучить библиотеки и архивы масонов. Зачастую РСХА одерживало верх, из-за чего ЭРР приходилось передавать конкурентам значительное количество уже конфискованной масонской литературы. Доступ в ложи считался важным с точки зрения обеспечения государственной безопасности, поскольку списки членов орденов, корреспонденция и другие материалы помогали выявить международные связи масонов. Однако было также ясно, что «оккультная литература», находившаяся в собственности лож, представляла огромный интерес для СС. РСХА уже составило богатую коллекцию литературы, конфискованной из немецких масонских орденов, которые до прихода нацистов к власти занимали второе место в мире по количеству членов. Кража книг и архивных материалов из немецких лож приобрела невероятные масштабы, причем большая часть награбленного в итоге осела в библиотеке литературы о врагах рейха, находившейся в VII Управлении РСХА в Берлине.