К судебной ответственности были привлечены 28 человек, разрабатывавших и проводивших политику агрессии. В большинстве своём обвиняемые являлись профессиональными военными, тесно связанными с «дзайбацу» и придворными кругами. Каждый из подсудимых в 1928–1945 гг. (период, охватываемый обвинением) занимал различные руководящие посты, активно участвуя в вовлечении Японии в войну.
Но не все виновные оказались на скамье подсудимых. Представители крупнейших японских монополий, финансировавших и направлявших агрессоров, не были привлечены к ответу, хотя советское обвинение настаивало на этом. Объяснялось это тем, что суды над монополиями могли вылиться в суд над империализмом, порождающим захватнические войны, а этого буржуазные политики допустить не могли. Поэтому в приговоре суда представители монополистического капитала фигурировали безлико: «промышленники», «дзайбацу», «банкиры».
Перед судом предстали премьер-министры Японии разных лет К. Койсо, Х. Тодзио, К. Хиранума, К. Хирота, вице-премьер-министр Н. Хосино, военные министры С. Араки, С. Итагаки, Д. Минами, С. Хата, военный вице-министр Х. Кимура, морские министры О. Нагано, С.Симада, морской вице-министр Т. Ока, командующий японскими войсками в Центральном Китае И. Мацуи, начальники бюро военных дел военного министерства А. Муто, К.Сато, член Высшего военного совета К. Доихара, начальник генерального штаба армии И. Умэдзу, министры иностранных дел И. Мацуока, М. Сигэмицу, С. Того, дипломаты Х. Осима, Т. Сиратори, министр финансов О. Кайя, организатор фашистского движения молодёжи К. Хасимото, идеолог японского фашизма С. Окава, лорд-хранитель печати К. Кидо, председатель планового комитета при кабинете министров Т. Судзуки (стр. 417–418).
Подсудимым было предъявлено обвинение в заговоре совместно с Германией и Италией с целью «обеспечить господство агрессивных стран над остальным миром и эксплуатацию его этими странами». Было выдвинуто 55 обвинительных пунктов, которые были разделены на три группы:
а) «Преступления против мира», включавшие подготовку и развязывание «агрессивных войн, нарушавших международное право»;
б) «Убийства», где подсудимым инкриминировались убийство военнослужащих и гражданских лиц при развязывании незаконных военных действий и прочие убийства с нарушением общепринятых законов и обычаев войны (расстрел военнопленных, массовые убийства гражданского населения);
в) «Военные преступления и преступления против человечности», подразумевавшие негуманное обращение с военнопленными и гражданскими интернированными лицами.
На вопрос, признают ли подсудимые себя виновными, все они ответили отрицательно. 3 июня обвинение приступило к предъявлению доказательств виновности подсудимых, включавших устные и письменные показания свидетелей и подсудимых, документальные и вещественные улики. Сложность возникла с документальными уликами, так как была уничтожена почти вся документация, которая могла бы изобличать милитаристов в совершении преступлений. Так, в циркулярной телеграмме начальника отделения лагерей для военнопленных, отправленной в войска 20 августа 1945 г., указывалось: «Личному составу, который плохо обращался с военнопленными и гражданскими интернированными лицами или к которому относятся с большим недовольством, разрешается ввиду этого немедленно переехать в другое место или скрыться без следа» (стр. 418–419).
Однако тщательные розыски документов, а также привлечение совершенно секретной японо-германской переписки, имевшейся в распоряжении разведывательных органов союзников, помогли подготовить убедительные доказательства, изобличавшие и в достаточно полном объёме раскрывавшие преступную деятельность подсудимых.
Обвинение представило обширные доказательства подготовки японского общественного мнения к войне: воспитание молодёжи в духе так называемых «самурайских традиций», распространение идей о превосходстве «расы Ямато» над другими народами, её миссии, состоявшей в осуществление принципа «хакко итиу» (создание колониальной империи под владычеством Японии). Доказывалось, что в стране насаждались политические организации профашистского толка, совершались террористические акты над политическими деятелями, неугодными милитаристам.
На рассмотрение трибунала были представлены многочисленные документы, доказывавшие интенсивность военных приготовлений Японии: постоянное увеличение численности армии, создание института тотальной войны, введение закона о всеобщей мобилизации, перестройка промышленности в соответствии с нуждами войны.
Первым агрессивным актом Японии был захват Маньчжурии, которая была оккупирована и в ней создано марионеточное правительство. В последующие годы агрессия в Китае продолжалась.