Дошел на арабском паруснике до Ходейды, и начал путешествие по Йемену. Видел и описал «Моху кофейну», «Ходейду корабельную», «Аден торговый» и «Сану дворцовую». Из Мохи планировал добраться до Маската, а оттуда — морем до Басры. Окончил, однако, свой жизненный путь в Йемене. По одним сведениям, путешественника убили в Ма’рибе, а караван его разграбили; по другим, — отравили, и скончался он в Таизе, в древней столице Йемена. К смерти Зеетцена был причастен, как говорят, то ли правитель одного из существовавших в то время в Йемене небольших независимых княжеств, то ли сам имам, верховный правитель Йемена. Зеетцена заподозрили в том, что он — колдун (из-за «коллекции змей, — как пишет Август Раллии, — консервированных в винном спирте»). Полагали, что с помощью этих змей, он воздействует на погоду, «и даже причинил засуху» землям Йемена. Как бы то ни было, но багажом его завладел имам. Однако, кроме астрономических инструментов, засушенных растений, записной книжки путешественника и небольшой суммы денег, в размере 600 пиастров, не обнаружил в нем больше ничего. Драгоценностей, будто бы найденных Зеетценом в Ма’рибе, как гласила людская молва, в багаже путешественника не оказалось. Дневники Зеетцена, заметки о местах пребывания и составленные им карты, а также списки химйаритских надписей, что он сделал в Ма’рибе, бесследно исчезли. Известно, что, отправляясь в путешествие во внутренние земли, он оставил все это на сохранение проживавшему в Мохе итальянцу Мензони, который, в свою очередь, перед смертью передал «вещи Зеетцена» одному индусу, маклеру Восточной Индийской Компании в Мохе. Некоторые из вещей Зеетцена (книги и записки) видел впоследствии в Забиде миссионер Джозеф Вольф (Josef Wolff), когда оказался там, по его словам, в 1836 г.
Воспоминания Зеетцена об аравитянах (те что сохранились во времени) — это богатый источник сведений об обычаях и нравах арабов Аравии XIX столетия. Гаспар Зеетцен обладал фено-минальным чутьем исследователя, исключительной памятью и талантом рассказчика. Южноаравийская письменность, одна из древнейших на земле, дошла до нас, благодаря в том числе и Гаспару Зеетцену. Он ярко описал жизнь и быт бедуинов-кочевников Верхней Аравии. Отзывается о них, как о людях, бережно хранящих «обычаи, язык и даже одежду предков». Нравы их простой «пастушеской жизни» удивительным образом, по его выражению, соседствуют с «богатым языком и любовью к стихотворству». Бедуины-кочевники, делится своими наблюдениями Зеетцен, — «страстные охотники до повестей о деяниях их предков; в них много остроты, живости и нравоучения». Бедуинских племен в Аравии, замечает путешественник, — множество.