В Берлине Кобулов начал с того, что попытался добиться беспрекословного подчинения оперработников, показав им, кто является «хозяином», а кто просто исполнителем. Одного из выпускников разведывательной школы — ШОН он попытался сделать своим переводчиком и чем-то вроде адъютанта и денщика одновременно. Он таскал его всюду за собой, мешая ему выполнять оперативные обязанности. Хождения начинались с утра, когда Кобулов посещал кафе. Заказав завтрак, он мгновенно проглатывал его и отправлялся в следующее кафе, так как одной порции ему не хватало. Как только молодой разведчик попробовал протестовать против отведенной ему роли, Амаяк свирепо набросился на него: ты забыл, с кем имеешь дело? Что ты по сравнению со мной?! Будешь пререкаться, сгною в подвалах Лубянки, выбирай! Разведчик, с трудом сдерживая себя, урегулировал отношения с Кобуловым, но постепенно все-таки отошел от него, найдя, казалось, защиту в лице посла Деканозова.
Кобулову поначалу не понравился и другой сотрудник резидентуры, его заместитель Коротков. Кобулов, кажется, недоумевал, за какие такие заслуги к нему направили этого высокого парня, немногословного, исполнительного, но имевшего на все свою точку зрения. Кобулову долго не удавалось его ухватить. Повидимому, Коротков, многое повидав, проявлял осторожность в отношении своего шефа. Тем не менее когда против Короткова была, как показалось, предпринята провокация местной контрразведки и Центр срочно отозвал его, Кобулов вдогонку послал объемистый пакет едва ли приятного для Короткова содержания. В результате Коротков пробыл в Москве не одну неделю.
Не владея немецким языком, Кобулов основное внимание сосредоточил на советской колонии, которую он по своему положению должен был оберегать от германской контрразведки.
В марте 1941 года Кобулов поссорился с заместителем торгового представителя СССР в Берлине Б., отчитав его за плохую организацию, как показалось
Кобулову, приема в честь прибывшей советской делегации и влепив для убедительности пощечину. Редчайший случай в практике совзагранучреджений за многолетнюю их историю! В объяснительной записке Кобулов писал, что его спровоцировали на эмоциональный взрыв, так как Б. на все слова «ехидно улыбался» и в конце якобы послал Кобулова подальше. При разборе проступка Кобулова на партбюро посольства по его адресу «безосновательно» были высказаны определения «враг» и «хулиган». Одновременно было предложено вывести Кобулова из состава партбюро и поставить перед Москвой вопрос об его откомандировании.
Это было серьезной угрозой. Кобулов поспешил надавить на Центр и возвести хулу на своих коллег. «Прошу т. Берию освободить меня от загранработы, с чем я уже обращался в Москву, — писал Кобулов. — Эта просьба мотивирована тем, что в посольстве и колонии сложилась склочная обстановка. Руководитель партбюро Филиппов явно не на своем месте. Он не годится для столь серьезной работы, и у него нет плана партийной работы. Он занимается сплетнями и к тому же пьет. Ко мне Филиппов настроен тенденциозно и относится необъективно... Верхушка партийного бюро, — строчил Кобулов, — явно разложилась. Именно Филиппов позволил себе оскорбить наркома Тевосяна, находившегося на приеме в торгпредстве, заявив в два часа ночи, что пора расходиться. Да кто он такой, чтобы указывать наркому, что ему делать?! Я за критику и самокритику. Прошу иметь в виду, что у меня заслуги перед государством, но я готов ответить за свой срыв», — закончил Кобулов объяснение, больше похожее на донос.
В Москву поступило сообщение посольства, поиному осветившее проступок Кобулова.
Необходимо было принять меры по спасению Амаяка, решил Берия, и информировал Сталина, Молотова и Микояна о случившемся. При этом было подчеркнуто, что Кобулов «переживал за свой проступок и осудил свою несдержанность». Одновременно Берия отправил письмо в Берлин, в котором осуждал проступок Кобулова, недопустимый в условиях пребывания за границей, и требовал исключить повторение чего-либо подобного в будущем. Кобулов легко отнесся к предосторожению Берии, посчитав его формальность и в глубине души, по-видимому, полагая, что брат Богдан всегда сумеет его прикрыть и оправдать в глазах Берии. Если он и не допускал подобных выходок, то совершал еще более опрометчивые и тяжелые по своим последствиям. У Захара было довольно поверхностное представление о конспирации. Вряд ли он смог бы дать вразумительный ответ, что это такое и для чего разведчику необходимо принимать меры особой предосторожности во время встреч с агентурой.
Разведывательное управление ГШ КА НКО уже предупредило руководство внешней разведки о том, что, по агентурным данным, гестапо в Берлине установило постоянное наблюдение за советником посольства в Берлине Кобуловым. Возможно, в наркомате обороны вспомнили о том, что внешняя разведка ранее сообщила о разработке абвером военного атташе Шорнякова, и не остались в долгу. Кобулов, несмотря на это, прихватив переводчика, попытался встретиться с Корсиканцем, о чем доложил в Москву постфактум.