Основы раздела Африки были определены на Берлинской конференции, состоявшейся в 1884–1885 гг. На ней собрались представители 15 европейских государств, чтобы согласовать свои колониальные требования. На конференции определили, что сферой влияния какого-либо государства являются внутренние области, находящиеся за прибрежной полосой, которой это государство управляет. Что предотвратить государства от чисто номинального создания колоний, провозгласили «принцип эффективности». Согласно этому принципу государство должно поднять там свой флаг, оформить соглашения с местными вождями, управлять колонией и поддерживать на ее территории порядок, а также развивать там экономику. Если какое-то государство окажется неспособным сделать это, то его территорию по праву может занять другое государство.
В определенных случаях колонизация облегчалась африканскими правителями, так как некоторые из них стремились заручиться поддержкой европейцев в борьбе против своих исконных врагов. Например, вожди народа буганда помогли англичанам захватить территорию для создания в 1903 г. Уганды. Другие поддались на обещания партнерства в торговых предприятиях. Однако после приглашения европейцев оказалось, что их уже невозможно удалить.
В многих случаях колонизацию осуществляли совместные организации, такие как Британская компания Южной Африки, Королевская компания Нигера, Германские Юго-Западноафриканская и Восточноафриканская компании, а также Португальская компания Ньясы. Такие компании обычно проводили колонизацию силовыми методами. Они отменяли существующее денежное обращение и правила торговли, а затем сами устанавливали налоги и захватывали территорию без уведомления об этом своих правительств.
Колонизация очень сильно изменила общество и культуру Африки. Чтобы выплачивать налоги, многим впервые пришлось работать по найму за заработную плату. Тысячи чернорабочих низкой квалификации устраивались работать на плантации каучука, сахара и какао, на предприятия по добыче полезных ископаемых или на строительство железных дорог. Железные дороги связали внутренние области континента с морскими портами, в результате чего развивалась торговля, росли города и зарождалась прослойка африканских торговцев.
В некоторых местах из-за колонизации сильно страдало местное население. Чернорабочие, занятые на плантациях какао в португальской колонии Сан-Томе и Принсипи, жили и работали в тяжелых условиях. Король Бельгии Леопольд II управлял в Конго как в своей частной феодальной вотчине. Он использовал принудительный труд миллиона конголезцев для добычи слоновой кости и производства каучука.
Колонизация, особенно в своих наиболее жестоких проявлениях, часто вызывала возмущение среди местного населения. Оно всячески сопротивлялось, начиная от неуплаты налогов и заканчивая отказом от работы и организацией вооруженного восстания. В 1892 г. произошло восстание иджебу — так раньше называли народ йоруба на территории современной Нигерии, в 1896 г. восстал народ матабеле, одно из племен зулусов, а в 1898 г. в Западной Африке протестовал народ мандинка.