Мир, который установился после первой войны между Афинами и Спартой (457–445), был лишь вынужденной передышкой. Напряженность между двумя соперничающими полисами продолжала подспудно расти, и в 431 г. снова вспыхнула война. Сила Спарты заключалась в ее армии, в то время как Афины полагались по преимуществу на свой военный флот. Каждый город строил свою стратегию на основании собственных преимуществ. Спарта оккупировала Аттику (область вокруг Афин) и опустошила ее земледельческие хозяйства, лишив город поставок продовольствия. Афины, предвидя это, впустили земледельцев Аттики в стены города и использовали флот для импорта продовольствия морем и нападений на побережье Пелопоннеса. Однако в 430–426 гг. на перенаселенный город обрушилась эпидемия чумы, унесшая жизни 30 000 афинян.
К 421 г. в войне сложилась патовая ситуация, когда ни один из противников не был в состоянии нанести решающий удар. Был заключен мир, однако на условиях, которые оттолкнули от Спарты пелопоннесских союзников, включая Аргос, Мантинею, Элиду и Коринф. Эти города образовали антиспартанский союз с Афинами. В 418 г. Спарта нанесла ему поражение при Мантинее. Мятежная коалиция распалась, и многие ее участники вернулись под крыло Спарты.
В 416 г. Афины организовали военную экспедицию в Сиракузы — союзный Спарте могущественный греческий полис на Сицилии. Этот поход обернулся огромной неудачей для афинян, которые потерпели сокрушительное поражение и на суше, и на море, потеряв большую часть своей 45-тысячной армии. Спартанцы усилили давление на своего врага, захватив и укрепив город Декелею в Аттике, тем самым отрезав сухопутные пути снабжения Афин, в том числе и серебром из афинских шахт. Дело Афин, казалось, было проиграно, когда в 412 г. спартанцы спровоцировали восстание афинских сторонников в Ионии и получили деньги и корабли от Персии для создания спартанского флота. Афины существовали еще некоторое время, поскольку ионийцы не спешили их атаковать, а персы также медлили со своими поставками в Спарту. Однако в 405 г. афинский военный флот был сокрушен спартанским флотом при Эгоспотамах. Без флота Афины не могли ни осуществлять контроль над своей империей, ни снабжать свой город. На следующий год Афины вынуждены были капитулировать. Пелопоннесская война закончилась.
Теперь Спарта стала самым могущественным полисом в Греции, но ее гегемония вскоре оказалась под угрозой. Ее соперники были недовольны тем, что соглашение Спарты с Персией позволяло персам контролировать Ионию. Между Спартой и четырьмя государствами — Афинами, Фивами,
Коринфом и Аргосом — в 395 г. началась война. Мирный договор, которым закончился этот конфликт, подтвердил статус-кво, и Спарта сохранила свое господство в Греции, а Персия — в Ионии.
Конец спартанской гегемонии пришел в 371 г., после поражения, нанесенного ее армии Фивами в битве при Левктрах. На протяжении некоторого времени Фивы главенствовали в Греции, но к 362 г. Греция находилась в состоянии смуты и почти непрекращающихся гражданских войн, при этом ни один полис не обладал могуществом, достаточным для того, чтобы навязать свою волю другим. Сцена была подготовлена для выхода новой силы, которая объединит все враждующие греческие полисы в одну мощную державу.