Узнав, что аргонавты прибыли за золотым руном, Ээт пришел в ярость. Желая погубить Ясона, он предложил ему вспахать поле на медноногих огнедышащих быках Ареса и засеять его зубами дракона, из которых вырастают воины (по другой версии, Ээт сначала потребовал, чтобы аргонавты помогли ему в войне против брата Перса). Однако Афина и Гера, стремясь помочь своему любимцу Ясону, попросили Афродиту, чтобы ее капризный малыш Эрот пробудил страсть к Ясону в сердце дочери Ээта волшебницы Медеи, – и Медея сразу по уши влюбилась в Ясона. Она с готовностью обещала ему свою помощь и в том, чтобы запрячь огнедышащих быков, и в том, чтобы добыть золотое руно, при одном-единственном условии – Ясон должен жениться на ней и взять с собой на «Арго». Медея вручила ему волшебное зелье – сок корней растения, выросшего из крови Прометея. Обмыв этим зельем свое тело, копье и щит, Ясон на один день стал неуязвимым. Так ему удалось подчинить своей воле быков и впрячь их в плуг. Весь день он пахал, а ночью посеял зубы, из которых тут же выросли могучие воины. Ясон устроил между ними драку, бросив в самую гущу воинов камень, а потом добил своим мечом тех, кто остался жив.
Царь Ээт не желал расставаться с золотым руном и беззастенчиво нарушил свое обязательство. Он стал грозить, что сожжет «Арго», теперь стоявший в море напротив города, и перебьет всех, кто на нем прибыл. Но Медея, на которую он неразумно положился, отвела Ясона и нескольких аргонавтов к священной роще Ареса, которая находилась в нескольких милях от города. Золотое руно охранял бессмертный дракон, свернувшийся в тысячи колец. Он был больше самого «Арго» и родился из крови чудовища Тифона, убитого Зевсом. Медея усыпила его сладким песнопением и волшебным снадобьем, после чего Ясон осторожно снял с дуба испускавшую золотое сияние шкуру и они поспешили на «Арго» (по другой версии, Ясон убил дракона).
Аргонавты вышли в море, но Ээт отправил в погоню несколько кораблей под началом своего сына Апсирта. На посвященном Артемиде острове Ясон вступил в переговоры с Апсиртом, который соглашался оставить золотое руно аргонавтам и позволить им продолжить путь в Грецию, однако настаивал на возвращении ему Медеи. Тогда Медея отправила тайное послание брату, в котором утверждала, будто ее насильно похитили, и умоляла спасти. Ночью, когда Апсирт явился на условленную встречу с сестрой, Ясон поразил его ударом меча в спину. После этого аргонавты напали на оставшихся без предводителя колхов, рассеяли их корабли и бежали. По другой версии, Апсирт в это время был еще ребенком, и Медея взяла его с собой в качестве заложника, а преследовал аргонавтов сам Ээт. Когда Медея увидела, что их настигают, она убила брата, разрубила его тело на куски и стала бросать их в море, зная, что отец вынужден будет прервать погоню, чтобы собрать тело сына и похоронить его. Чтобы очистить Медею от греха убийства, влюбленные отправились на остров Эя, где жила волшебница Кирка. С большой неохотой, лишь уступая настойчивым просьбам племянницы, Кирка провела обряд, и они поплыли дальше. На острове Схерия аргонавтов радушно приняли Алкиной и Арета, царствовавшие над феаками. В это время их настигла вторая половина флота колхов, посланного за ними вдогонку Ээтом. По совету Ареты Ясон и Медея немедленно вступили в брак, и Алкиной получил основание не отправлять Медею к отцу.
Вернувшись в Иолк, Ясон узнал, что Пелий, считая его погибшим в Колхиде, вынудил его отца и мать покончить жизнь самоубийством, а его маленького брата, родившегося уже после отплытия аргонавтов, убил, безжалостно разбив его голову об пол дворца. Посвятив «Арго» Посейдону, Ясон с помощью Медеи отомстил Пелию: дочери Пелия по наущению Медеи, желая вернуть отцу молодость, разрубили его на куски. Воцарившийся в Иолке сын Пелия Акает изгнал Ясона и Медею из города (отомстив Пелию, Гера сочла свою цель достигнутой и больше Ясону не покровительствовала).
Ясон и Медея отправились в Коринф, где их приютил царь Креонт, и прожили там десять лет. За это время у них родилось много детей (некоторые говорят, что четырнадцать, другие считают это явным преувеличением). Ясон принял участие в калидонской охоте, на которой не смог даже задеть вепря своим копьем. Медея надоела ему, и он попросил у Креонта руку его дочери Главки (по другой версии – Креусы). Креонт охотно дал согласие на этот брак и приказал Медее отправиться в изгнание. Оскорбленная Медея с притворной покорностью послала невесте свадебный подарок – пропитанные ядом золотую корону и белый пеплос. Стоило Главке надеть их на себя, как незатухающее пламя охватило не только ее (хотя она с головой бросилась в дворцовый фонтан), но и пытавшегося сорвать с дочери отравленный наряд Креонта и всех других, оказавшихся во дворце. Ясону удалось спастись, выпрыгнув из окна верхнего этажа.