Между тем заговорщики, во главе с инженером Ясинским, в 11 часов вечера 9 апреля (это было как раз в Великую субботу под Светлое Христово Воскресение) собрались на предместье г. Вильны Заречье в одном саду. Туда привезли артиллерию, и там они условились, как овладеть гауптвахтою и арестовать русского генерала и офицеров. Ровно в 12 часов ночи раздался пушечный выстрел, вслед за тем ударили по костелам в набат, забили в барабан. Выстрелы пошли все чаще и чаще. Заговорщики, одни с ружьями, другие с кольями, саблями, ножами, забегали по разным улицам, и толпы их постоянно увеличивались. Майор Собецкий с жолнерами 7-го полка напал на гауптвахту, истребил караул и захватил 8 орудий. Затем он бросился на квартиры, где стояли русские офицеры, и там без особого труда арестовал коменданта Ребка, полковника Яковлева, пять майоров, четырех капитанов, 11 подпоручиков, 8 поручиков и 12 прапорщиков. В то же время арестованы были генерал Арсеньев и гетман Коссаковский; первого заговорщики поймали на Антоколе, у одной польки, с которою он проводил вечер в интимной беседе, а второго у себя дома на чердаке, за трубой.
Из всех русских офицеров спаслось не более пяти человек, в числе которых был и полковник Тучков. Последний на следующий день, когда у него собралось войско около 3000 человек, вместе с денщиками и лакеями, открыл бомбардирование по Вильне. Поляки попытались было в числе нескольких сот человек сделать нападение на Тучкова, но все легли под картечным огнем. Затем заговорщики заставили было генерала Арсеньева отправить письмо к Тучкову с приказанием прекратить пальбу, ввиду угрожающей ему, Арсеньеву, опасности; но Тучков не послушался и как бы в ответ на это приказание усилил канонаду. Но, несмотря на все это, положение Тучкова день ото дня становилось все более и более критическим: с фронта ему угрожали польские войска из города, где их уже было много, вследствие прибытия новых подкреплений, с тылу угрожал корпус Гедройца, только что сформированный и спешивший по Ошмянскому тракту к Вильне, в то же время у Тучкова приходили к концу съестные припасы и боевые снаряды. Ввиду всех этих обстоятельств Тучков 14 апреля отступил к Понарским высотам, а затем направился к Гродне, где находились русские войска под начальством князя Цицианова. На пути на него напал Гедройц с своими войсками, но был отражен с большим уроном. 17 апреля Тучков с своим отрядом и пушками прибыл в Гродну; тут он как герой встречен был Цициановым и его войсками, с музыкой и пальбой. Тучков за свой подвиг награжден был большою суммою денег, как и весь его отряд.
Между тем в Вильне, как скоро стало известно об удалении Тучкова, на рынке собралось народное собрание, которое провозгласило республиканское устройство; для управления страною составился так называемый «Литовский верховный совет». Ясинский сделан был начальником «вооруженных народных сил». Тогда же произведен был военный суд над гетманом Коссаковским за арестование Ясинского и вообще за несочувствие его к революции; суд приговорил его к смертной казни чрез повешение. 15 апреля, в четверг на Святой неделе, последнего литовского гетмана Коссаковского при огромном стечении народа, с барабанным боем, привезли на ратушскую площадь, где уже была приготовлена виселица. Вслед за тем ему прочитали обвинительный акт. Бернардинский монах исповедовал его. Когда гетмана подвели к виселице, то он, обратившись к народу, хотел что-то сказать, но барабанный бой заглушил его слова. Приговоренный к виселице Коссаковский кончил свою жизнь самым мучительным образом вследствие неискусства палача.
Революционеры управляли Вильною около трех месяцев. 8 июля того же года русские войска под начальством генерала Кнорринга подступили к городу и повели правильную осаду. 31 июля сделан был общий приступ; польские войска не выдержали его и разными путями бежали из города, который тотчас же был занят русскими. При вступлении русского войска в Вильну по правую сторону большой улицы стояли русские, а по левую – поляки на коленях. Генерал Кнорринг, вступивши в город, сошел с лошади, приложился к кресту, поднесенному ему игуменом Свято-Духовского монастыря, а потом, снова севши, обратился к полякам и громко сказал: «Императрица Екатерина объявляет всем прощение. Встаньте!» Поляки немедленно встали на ноги и закричали: «Виват!» С этого времени русские войска уже более не выходили из Вильны, которая скоро после этого со всею Литвою (за исключением Белостокской области) была присоединена к России.
14 декабря 1795 г. Екатерина II образовала в Литве две губернии: Виленскую и Слонимскую, а через год эти две губернии составили одну, под названием Литовской.