Коллективизированное сельское хозяйство Литвы специализировалось на мясном и молочном животноводстве, то есть производило лучшее, что было возможно в условиях Литвы. Ожидалось, что этот сектор экономики выиграет от мелиорации земель (к 1985 году было мелиорировано около 2,5 миллионов гектаров земли, и во многих местах это полностью изменило ландшафт), механизации и электрификации труда (электрификация была в основном завершена в 1979 году), а также от использования химикатов (Кедайняйский химический комбинат и Йонавский завод азотных удобрений полностью обеспечивал Литву удобрениями, и их использование значительно повысило урожайность, но также создало серьезные экологические проблемы). Вместе с разрушением усадеб начались специализация и концентрация сельскохозяйственного производства. Это помогло поднять уровень сельскохозяйственного производства, и сельское хозяйство Литвы стало наиболее развитым в Советском Союзе.
В 1960-х годах сельское хозяйство Литвы достигло довоенного уровня. Урожайность сельскохозяйственных культур значительно возросла. В 1975 году урожайность составляла 23 центнера с гектара (в среднем по СССР было 14,7 центнера с гектара). В 1976 году урожайность возросла почти до 30 центнеров с гектара, а общий урожай превысил 3 миллиона тонн. В то время это было почти равно мировому стандарту в развитых странах — 1 метрическая тонна зерна на душу населения. В последующие годы урожайность зерна составляла около 25-27 центнеров с гектара.
Государство предоставляло кредиты, которые позже были списаны, коллективным хозяйствам, работавшим в убыток. Доход семей членов коллективных хозяйств от колхоза, по официальным данным, составлял 57%, хотя на самом деле он должен был быть выше, потому что фермеры неофициально использовали колхозную технику, удобрения и т.д. для их личных нужд. Это обстоятельство позволило фермерам решать проблемы своих личных подсобных хозяйств, а также связанные с ними социальные проблемы.
По производству животноводческой продукции на душу населения Литва была лидером в Советском Союзе. Было построено много ферм. В 1984 году в Литве насчитывалось 472 гола крупного рогатого скота, 32 свиньи, пять крупных птицефабрик и т.д. По мнению некоторых авторов, Литва превратилась в огромную ферму. Это полностью соответствовало интересам Советского Союза и на некоторое время помогло решить проблему снабжения продовольствием крупных российских городов. Однако мясные продукты, такие как копченые колбасы или свежее мясо, были в постоянном дефиците в Литве, особенно в сельской местности и небольших городах. Жители ездили в крупные города Литвы и стояли в длинных очередях, чтобы купить эти продукты. Представители партийной номенклатуры покупали эти продукты в специально предназначенных для них магазинах.
Значительная часть сельскохозяйственной продукции производилась на небольших личных подсобных хозяйствах коллективных фермеров. Это показало преимущество личного подсобного хозяйства по сравнению с совхозом, хотя постепенно абсолютный объем сельскохозяйственной продукции на подсобных хозяйствах колхозников снижался: в 1959 году он составлял 57,6%, а в 1976 году — 30,9%. В 1975 году личные подсобные хозяйства производили 31% всего мяса (туш) и 40% всего молока. Правительство приветствовало эту тенденцию и заявило, что потенциал государственного (официально «общественного») сектора увеличился. В 1976 году в личных подсобных хозяйствах насчитывалось 655 000 голов крупного рогатого скота, 571 000 свиней и 5,6 миллиона голов домашней птицы. Позже эти цифры немного снизились: в 1989 году здесь было 544 000 голов крупного рогатого скота, 500 000 свиней и 5,4 миллиона домашней птицы, потому что их количество было ограничено: разрешалось держать одну корову, двух свиней на мясо, а также домашнюю птицу и пчел в зависимости от обстоятельств. Руководство ЛССР боялось, что колхозники разбогатеют на своем труде.
Система ведения сельского хозяйства, основанная на обязательном труде работников колхозов и административных методах управления, была неэффективной — производство и себестоимость продукции не снижались. Созданные крупные хозяйства не были прибыльными, поэтому государство предоставило кредиты им и другим хозяйствам. Однако в официальных документах Москва очень хорошо оценивала сельское хозяйство Литвы. В Литве были достигнуты и даже перевыполнены не только пятилетние планы, но и сельскохозяйственные планы почти на каждый год, в то время как в то же время публично признавалось, что они не были выполнены в республиках Центральной Азии и во многих регионах России. Только Эстония, Латвия, Беларусь и немного Молдова могут сравниться с Литвой.