Широкое применение БОВ получили в ходе затяжного Ирано-Иракского конфликта. Как Иран, так и Ирак (5 ноября 1929 г. и 8 сентября 1931 г. соответственно) подписали Женевскую конвенцию 1925 года о нераспространении химического оружия. Однако Ирак, стремясь переломить ситуацию в позиционной войне, начал активно использовать химическое оружие. Эта тактика принесла некоторые плоды. В ходе битвы за острова Маджун БОВ сыграли важную роль в срыве иранского наступления. Ирак первым применил БОВ, в том числе табун, против Ирана. Эксперты ООН подтвердили использование химического оружия Ираком, но это не вызвало международного протеста. В ответ Иран начал собственную программу по химическому оружию. Во время Ирано-Иракской войны США были заинтересованы в поддержке Ирака, так как в случае его поражения Иран мог сильно расширить влияние фундаментализма на весь регион Персидского залива. Рейган, а впоследствии и Буш-старший, видели в режиме Саддама Хусейна важного союзника и защиту от угрозы, которую представляли собой пришедшие к власти в результате иранской революции 1979 года последователи аятолла Хомейни. Успехи иранской армии вынудили руководство США предоставить Ираку военную помощь и информацию о дислокации иранских войск. В качестве одного из средств, призванных сломить дух иранских солдат, было выбрано химическое оружие. До 1991 г. Ирак обладал крупнейшими запасами химического оружия на Ближнем Востоке и проводил широкие работы по дальнейшему совершенствованию своего арсенала. В его распоряжении имелись БОВ общеядовитого (синильная кислота), кожно-нарывного (иприт) и нервно-паралитического (зарин, зоман, табун, VX) действия. Химический боезапас Ирака включал более 25 боеголовок для ракет «Скад», около 2000 авиабомб и 15000 снарядов. С 1982 г. отмечалось использование Ираком слезоточивого газа (CS), а с июля 1983 г. – иприта. К началу Ирано-Иракской войны иракская армия имела 120-мм миномётные мины и 130-мм артиллерийские снаряды, снаряжённые ипритом. Первый случай применения табуна был отмечен в 1984 г., однако Иран заявлял и о 10 случаях применения табуна в 1980–1983 г.г. Никакой реакции в мире на это не последовало. Только после заявления Ирана в 1984 г., в котором он констатировал 53 случая применения Ираком химического оружия в 40 приграничных районах, ООН предприняло некоторые шаги. Проверка группы инспекторов ООН выявила следы БОВ в районе Хур-аль-Хузвазех, где 13 марта 1984 г. была химическая атака Ирака. С этих пор свидетельства использования Ираком ОВ стали появляться в массовом порядке. Введенное Совбезом ООН эмбарго на поставку в Ирак ряда химических веществ и компонентов, которые можно было бы использовать для производства БОВ не смогло серьезно повлиять на ситуацию. Заводские мощности позволяли Ираку в конце 1985 г. производить в месяц 10 т БОВ всех типов, и уже в конце 1986 г. более 50 т в месяц. В начале 1988 г. мощности были доведены до 70 т иприта, 6 т табуна и 6 т зарина (т. е. почти 1000 т в год). Шли интенсивные работы по налаживанию производства VX. В 1988 г. при штурме города Фао иракская армия осуществила бомбардировку иранских позиций с применением БОВ, скорее всего нестойких рецептур нервно-паралитического действия. С апреля 1984-го по август 1988 г. химическое оружие было применено Ираком свыше 40 раз (всего более 60). От воздействия этого оружия пострадало 282 населенных пунктов. Точное число жертв химической войны со стороны Ирана неизвестно, но их минимальное количество оценивается экспертами в 10 тысяч человек. Но в эти годы западные страны (да и СССР, испытывающий экономические трудности) не обращали на это особого внимания.
Нападение Ирака на Кувейт (1990 год) изменило ситуацию. Международные санкции привели экономику Ирака в состояние острого кризиса. Ираку было объявлена морская блокада и торговое эмбарго, а также ультиматум ООН с угрозой ввода Межнациональных Сил, в которых приняло участие более 40 государств. 28 февраля 1991 года Хуссейн объявил о прекращении огня и принятии Ираком всех требований ООН. Война имела тяжёлые экологические последствия для региона. Иракские войска организовали сброс кувейтской нефти в Персидский залив, поджигали нефтяные скважины. На Ирак была наложена огромная контрибуция, санкции были пролонгированы до полного уничтожения оружия массового уничтожения. В стране царили голод и разруха. Страна медленно восстанавливалась.