Между державами возникли разногласия: представители России и США стояли за более мягкие условия, в то время как представитель Германии настаивал на самых жестоких репрессиях в отношении Китая; проявило неуступчивость по ряду пунктов и маньчжурское правительство — все это затянуло подписание Заключительного протокола почти на год.
Заключительный протокол, состоявший из 12 статей, предусматривал следующие обязательства Китая:
Статья 1 (а). Направить в Берлин искупительную миссию во главе с князем императорской крови для выражения сожаления императора Китая и китайского правительства по поводу убийства германского посланника барона Кеттлера.
б) Соорудить на месте, где было совершено убийство, мемориальный монумент, соответствующий рангу покойного. На монументе сделать на латинском, немецком и китайском языках надпись, выражающую сожаление императора Китая по поводу убийства.
Статья 2 (а). Строжайше наказать лиц, сообразно вине каждого, в соответствии с императорским указом от 25 сентября 1900 г., а также тех, которые будут определены представителями держав.
б) Приостановить государственные экзамены в течение пяти лет в местах, где совершалось убийство иностранцев или они подвергались жестокому обращению.
Статья 3. Китайское правительство направляет в Японию искупительную миссию для выражения соболезнования но поводу убийства секретаря японского посольства Сугияма.
Статья 4. Китайское правительство устанавливает искупительные памятники на всех иностранных кладбищах, которые были осквернены или разрушены.
Статья 5. Согласно условиям, определенным державами, запрещается ввоз оружия, а также материалов, которые могут быть использованы для производства оружия и боевых припасов.
Статья 6(a). Справедливо вознаградить сотрудников провинциальной администрации, общественных организаций и отдельных лиц, а также тех китайцев, которые в последних событиях пострадали лично или понесли убытки в имуществе, находясь на службе у иностранцев.
б) Китай выплачивает державам контрибуции в размере 450 миллионов ляпов в течение 39 лет.
Статья 7. Каждая держава сохраняет за собой право иметь постоянную охрану своего посольства, а на территории посольского квартала устанавливается система обороны. Китайцы не имеют права проживать на территории посольского квартала.
Статья 8. Форты Дагу и другие форты, препятствующие свободному сообщению между Пекином и побережьем, подлежат полному разрушению.
Статья 9. Право на военную оккупацию некоторых пунктов определяется соглашением между державами с целью поддержания коммуникаций между Пекином и морским побережьем.
Статья 10 (а). Китайское правительство в течение двух лет во всех административных центрах вывешивает для всеобщего обозрения императорские указы о запрещении на неопределенный срок под страхом смертной казни участия в антииностранных обществах. В городах, где совершалось убийство иностранцев или они подвергались жестокому обращению, будут временно приостановлены государственные экзамены…
в) Все наместники, губернаторы, провинциальные и местные чиновники обязаны нести ответственность за порядок в соответствии с их юридическими правами. Где бы ни произошло антииностранное выступление или нарушение Заключительного протокола, если это не будет немедленно пресечено и виновные не будут наказаны, то официальные лица будут уволены со службы без права занять новый пост или получить хороший отзыв.
Статья 11. Правительство Китая обязуется внести поправки в договоры, касающиеся торговли и мореплавания, в интересах держав, а также обязуется произвести работы на реках Бэйхэ и Хуанхэ для облегчения судоходства между Тяньцзинем и Шанхаем.
Статья 12. Правительство Китая осуществит реформы в области отношений с иностранцами, упразднит дворцовые церемонии (челобитье) при приеме иностранных представителей по форме, которая будет предложена державам.
7 сентября 1901 г. под Заключительным протоколом поставили свои подписи представители маньчжурского правительства Ли Хунчжан и князь Цин (И Куан), а также посланники 11 государств (Германии, Австрии, Бельгии, Испании, США, Франции, Англии, Италии, Японии, Голландии и России).
Заключительный протокол создавал благоприятные условия для дальнейшего усиления позиций держав в Китае. В Пекине был учрежден посольский квартал, который полностью находился под юрисдикцией держав; улицы посольского квартала патрулировались иностранной полицией. Китайцы, кроме слуг, не имели права здесь проживать и иметь имущество. Ни один вооруженный китаец не смел появляться на территории посольского квартала. По существу, в черте столицы Китая — Пекине находился иностранный город, где державы имели свои банки, клубы, гостиницы, магазины.
Так проводилась капитулянтская политика маньчжурского правительства: клика Цыси больше всего боялась не иностранных захватчиков, а китайского народа.
Возвращение Цыси и Гуансюя из «самоизгнания»