24 сентября все три немецких корпуса отражали атаки противника на рубеже «Рён—Рюдигер». На главном направлении, в центре перешейка, стояла 97-я егерская дивизия.
В ночь на 25 сентября русские войска высадились в 6 километрах западнее Благовещенской. На следующее утро последовала фронтальная атака советских войск при поддержке 15 танков на узкой косе у Благовещенской. Части румынской 9-й кавалерийской дивизии полковника Грунау были опрокинуты, и отход их был серьезно затруднен. В полдень находившийся на привале в Уташе 1-й батальон 13-го горнострелкового полка был поднят по тревоге и направлен на помощь румынам. Немцы и румыны дрались плечом к плечу и отходили к следующей позиции.
В ночь на 25 сентября советские войска высадились в Темрюкской бухте, чтобы отрезать группе Беккера путь к отступлению. После ожесточенного боя десант был уничтожен, а продолжавшие подходить десантно-высадочные средства противника вынуждены были повернуть обратно. Генерал Конрад отметил в приказе части, участвовавшие в разгроме десанта противника:
«25 сентября 1943 года был полностью уничтожен противник численностью 800 человек (части 389-й стрелковой дивизии и 369-й батальон морской пехоты), высадившийся в тылу 49-го горнострелкового корпуса под Темрюком и Голубицкой. Благодаря этому удалось предотвратить выход противника на важнейшие пути снабжения. Результат этого боя является особой заслугой командира 123-го гренадерского полка полковника Бирмана и командира 666-го гренадерского полка полковника Бабеля...»
Утром того же дня советский 11-й стрелковый корпус начал наступление по обе стороны дороги Курчанская — Темрюк. Оно было отражено частями 50-й и 370-й пехотных дивизий и 101-й егерской дивизии. Последняя, после отхода из района Киевского частью сил обеспечивала охрану побережья Азовского моря и плавней.
К вечеру 25 сентября 5-й армейский корпус отошел на «Малую позицию гота». В ночь на 26 сентября группа Беккера заняла «Позицию Оденвальд», а через 24 часа отошла на «Малую голову гота». После того как был оставлен Темрюк и взорван мост через Кубань, оборона проходила восточнее Голубицкой по самому узкому участку северного перешейка.
С уходом на «Малую голову гота» удалось добиться большого сокращения линии фронта. Освободившиеся дивизии были переправлены в Крым. Кроме того, туда же направились управления 5-го армейского и 44-го егерского корпусов, 125-я пехотная дивизия (она начала переправу своих первых частей еще 7 сентября), 9-я пехотная, 101-я егерская дивизии, румынские 1-я горнострелковая и 10-я пехотная дивизии, 73-я и 79-я пехотные дивизии и румынская 9-я кавалерийская дивизия. Оборона «Малой головы гота» была поручена теперь только 49-му горнострелковому корпусу в составе групп Беккера и Сикста. Обороной центрального участка руководило непосредственно командование корпуса. Фронт обороняли (с севера на юг): 50-я и 370-я пехотные дивизии Беккера, 98-я пехотная и 97-я егерская дивизии (на центральном участке), 4-я горнострелковая и румынская 19-я дивизии Зикста.
В Керченском проливе царило оживление. По точным планам осуществлялась переправа подходивших соединений. Общее руководство перевозками осуществляли адмирал Черного моря вице-адмирал Кизерицки и морской комендант Кавказа капитан 1-го ранга Граттауэр. В переправе участвовали: 1-я (капитан-лейтенант Гиле), 3-я (капитан 2-го ранга Штремпель), 5-я (капитан 3-го ранга Мелер) и 7-я (капитан 3-го ранга Штельцер) десантные флотилии, а также 770-й саперный десантный полк полковника Хенке.
Перевозка войск осуществлялась на морских и саперных десантных паромах (паромах грузоподъемностью 60 т), саперных десантных катерах (грузоподъемностью 30 т), паромах Зибеля (силовая установка — 2 авиационных двигателя, грузоподъемность — 10 т) и лихтерах.
Конвои проходили по следующим маршрутам: Керчь — Темрюк (конвои «Тони» и «Теодор»), Керчь — Тамань (конвои «Банзин» внутреннего сообщения) и, первое время, Керчь — Анапа (конвои «Хаген»).
Охрану побережья и конвоев обеспечивали силы флота, состоявшие из мелких кораблей. Часто они заходили в порты только для пополнения запасов, а потом снова выходили в море. У экипажей мелких открытых кораблей часто не было возможности принимать горячую пищу и спать, особенно плохо им приходилось в непогоду.