Некоторые авторы упрекают Клюне в пассивности на стадии рассмотрения кассационной и апелляционной жалоб по делу Маты Хари. Но, во-первых, весьма вероятно, что семидесятипятилетний мэтр в это время был болен, подхватив осеннюю простуду. Во-вторых, что еще важнее, он прекрасно понимал особенности военной юстиции и обстановку, сложившуюся во Франции в тот момент. Поэтому Клюне прекрасно сознавал, что шансы на смягчение приговора Мате Хари в кассационной и апелляционной инстанциях равны нулю. После того, как не удалось затянуть рассмотрение апелляционной жалобы, в надежде, что общественное мнение немного успокоится, Клюне все надежды возлагал на помилование Маты Хари президентом Французской Республики. И только на этой стадии могло вмешаться голландское правительство, подкрепив просьбу о помиловании своим обращением (такое обращение на более ранних стадиях было бы сочтено давлением на французскую судебную систему и тем более отклонено). По совету Клюне, оно так и сделало, но, к сожалению, спасти Мату Хари не удалось. Однако в этом нельзя винить Клюне. Как защитник, он сделал все, что мог, и свой долг выполнил.
Получив послание от Клюне, голландское правительство после заседания 29 сентября отправило следующую телеграмму за подписью министра иностранных дел Джона Лаудона в посольство в Париже: «Попросите пощады для лица, упомянутого в вашем № 2219».
Ни королева Вильгельмина, ни премьер-министр Нидерландов, которым в то время был Питер Корт ван дер Линден, вопреки распространенному мнению, о помиловании Маты Хари не просили. Уровень ходатайства ограничился министром иностранных дел. 1 октября посольство передало соответствующее обращение во французский МИД. Посол де Стюерс писал министру иностранных дел Франции Александру Рибо:
«Господин министр,
Мое правительство поручило мне, исходя из соображений гуманности, просить помилования для мадам Зелле-Маклеод, известной как Мата Хари. 25 июля она была приговорена к смерти Третьим военным судом. Апелляция была отклонена 28 сентября Коллегией по уголовным делам апелляционного суда…
Я имею честь просить о дружеском посредничестве Вашего высокопревосходительства при передаче Президенту Республики этой просьбы Ее Величества, и я был бы вам весьма признателен, если Ваше высокопревосходительство дружески проинформирует меня об успехе этого прошения».
В тот же день о посланном прошении информировали адвоката Клюне. 13 октября, в субботу, МИД Голландии послал в Париж телеграмму, где было сказано, что шесть голландских газет сообщили о казни Маты Хари. Париж должен был немедленно ответить, «во избежание дальнейших комментариев». Ответа не последовало, может быть, из-за выходного дня.
А утром 15 октября в голландское посольство поступило сообщение мэтра Клюне: «Просьба о помиловании отклонена». Но к этому времени Мата Хари уже погибла.
Все дни, прошедшие от момента отклонения апелляции до казни, Мата Хари очень плохо спала. За исключением суббот, поскольку по воскресеньям никогда не казнили.
В воскресенье, 14 октября 1917 года, в шесть часов вечера, капитан Бушардон направил из парижского штаба армии копию приказа о проведении казни «Правительственному уполномоченному при Третьем Парижском военном трибунале, господину коменданту Эмилю Массару», располагавшемуся в Доме инвалидов. В послании говорилось:
«Имею честь письменно подтвердить мой телефонный разговор этого дня:
Казнь осужденной Зелле, прозванной „Мата Хари“, произойдет завтра утром, 15 октября 1917 года, на Венсенском полигоне, в 6 часов 15 минут.
Машина прибудет с г-ном капитаном Бушардоном, с бульвара Перейр, в 4 часа.
Вторая машина прибудет с г-ном капитаном Тибо, с площади Вожирар, в 4 часа 30 минут.
Машина с осужденной, из тюрьмы Сен-Лазар, в 5 часов.
Она также заберет господина генерального адвоката Ваттена (главного военного адвоката.
Массар утверждал: «Получать приказ о казни мужчины или женщины всегда неприятно. Приказ о казни Маты Хари не вызвал у меня чрезмерного волнения. На самом деле я уже присутствовал на обоих закрытых судебных заседаниях военного трибунала и поэтому знал, за что и как судили знаменитую танцовщицу». Таким образом, по крайней мере в тот момент, он не сомневался в ее виновности.
Доктор Бизар в тот же вечер был проинформирован о приказе и в сопровождении сестры Леониды навестил Мату Хари в камере. Они говорили о разных малозначительных вещах. Сестра спросила Мату Хари, как, собственно, она танцевала. Мата Хари продемонстрировала пару менуэтов. Она не плакала и не показывала отчаяния, лишь с грустью заметила, что не может понять французов. Но доктор Бизар, в одночасье превратившийся во французского патриота, писал, что «она до конца играла свою роль, состоящую из храбрости и равнодушия». Он видел перед собой шпионку, продолжавшую борьбу до самого конца, а не несчастную невинную женщину, ставшую жертвой шпиономании, политических обстоятельств и безжалостной судебной машины, но сумевшую сохранить мужество до самой смерти.