14.10.1944 года приказом № 0580 командующий КБФ расформировал роту особого назначения водолазов-разведчиков. «
Бессменный командир РОН — Иван Васильевич Прохватилов — и после войны остался верен легководолазному делу. После окончания войны он был назначен начальником военно-водолазной школы, а затем водолазным специалистом в аварийно-спасательный отдел (АСО) штаба 4-го ВМФ. В 1951 году Прохватилов являлся научным сотрудником водолазного отдела (с 1951 года — спецлаборатории) НИИ №11 ВМФ СССР. Только в 1953 году по состоянию здоровья он ушел в запас в звании капитана 2-го ранга. Всю оставшуюся жизнь Прохватилов посвятил военно-патриотическому воспитанию молодежи.
Если говорить о Черноморском флоте, то на нем с начала войны стали действовать водолазы-минеры. По западной классификации они относились к боевым пловцам. Но их тогда в советском ВМФ так не называли. 22.06.1941 года военно-воздушные силы Германии один из первых ударов нанесли по Севастополю — главной базе Черноморского флота. Их целью являлось блокирование сил флота в базе через минирование судоходных фарватеров, рейдов, бухт. Использовались секретные неконтактные донные мины, на которые не действовали обычные тралы. Всякие попытки минеров Черноморского флота демонтировать и исследовать эти изделия заканчивались гибелью людей.
У помощника флагманского минера капитан-лейтенанта Г.Н. Охрименко возникла идея разоружения мины под водой с помощью водолазов. Но легководолазное дело пришлось осваивать самим минерам. В интересах дела это было более целесообразно, чем обучать минной специальности водолазов. Для работы на дне решено использовать не автономное, а вентилируемое снаряжение. Оно позволяло дольше находиться под водой, что имело огромное значение при разминировании неизвестных моделей морских мин.
Первые попытки подобраться к секрету немецкой мины потерпели крах. То мина самоликвидировалась при транспортировке, то артиллерийский обстрел не позволял закончить работу. В один из таких артналетов Г. Охрименко получил под водой контузию. Скоро ему на помощь пришли опытные водолазы-черноморцы: Викулов, Болтов, Мищенко и другие. Взаимно обучая друг друга, они вместе осваивали профессию боевого пловца-минера. Тренировки проводили в Южной бухте Севастополя. Шла подготовка и специального инструмента из немагнитного материала, с помощью которого планировалось продолжить работы над секретами мины.
В штабе флота торопили. Минная опасность сковывала действия Черноморского флота, оперативное развертывание его сил. Наконец наступил день, когда одна из мин была разоружена под водой водолазом Викуловым и с большим трудом под обстрелом доставлена в Песочную бухту. На берегу в поединок с «подводной смертью» вступит капитан-лейтенант Г. Охрименко. На разгадку ее тайны понадобятся две ночи. К концу второй секрет мины был раскрыт. Она классифицирована как комбинированная — магнитно-акустическая. В последующем группа водолазов-минеров успешно работала по разминированию морских мин на Керченском полуострове, в Новороссийске, Геленджикской бухте. На их счету раскрытие секрета другой немецкой новинки — беспарашютной мины-бомбы «Ж». Заслуга в этом принадлежала водолазу Л. Викулову. «
На Черном море в апреле 1944 года была сформирована небольшая группа разведчиков-водолазов. Она состояла из 10 человек, командовал ею ст. лейтенант С.С. Осипов. Насколько известно группа выполнила только одну боевую задачу: по ведению разведки из района поселка Любимовка за передислокацией немецких кораблей в районе Севастополя. Действовала она 05.04.—10.05.1944 года. После освобождения главной базы от противника водолазы-разведчики Осипова погружались на погибшие немецкие суда с целью изъятия с них шифртаблиц, карт минной обстановки, секретных документов. В конце 1945 года спецподразделение постигла участь его собрата на Балтийском море. Оно было расформировано.
Во время сражений на северном направлении Великой Отечественной войны — на побережье норвежской провинции Финмарк действовали от 4 до 9 разведгрупп 181-го разведотряда штаба Северного флота. Они отслеживали обстановку на глубину до 300 км. Некоторые разведчики находились в тылу противника до 6 месяцев. Однако использование подводного снаряжения для активных диверсионных действий было исключено.