Самые ранние иконы из музейного собрания - «Св. Никола», «Спас Вседержитель», «Богоматерь Смоленская» - относятся к XVI столетию. Они неоднократно поновлялись и переписывались. Наиболее цельное впечатление производит «Спас Вседержитель», иконографический тип которого восходит к поясным деисусным чинам [1] XV века. Образ Спаса - задумчиво-спокойный, преисполненный учительской мудрости, глубоко человечный - заставляет вспомнить лучшие произведения древнерусской живописи, выразившие идеалы высокой духовности и нравственного совершенства. Прозрачная живопись лика с тонким рисунком удлиненных глаз, узкого носа, маленького изящного рта позволяет приписать произведения мастеру московской школы, находившемуся под влиянием искусства Андрея Рублева.
О путях дальнейшего развития иконописи можно судить на примере иконы «Несение икон Владимирской и Смоленской Богоматери». Памятник датируется первой половиной XVII века. Подобные композиции известны с конца XVI столетия. Появлению и распространению их способствовал возросший интерес к реальному миру.
Сюжет «Несения икон» имеет историческую основу. Изображено торжественное многолюдное шествие, какое не раз случалось видеть жителям русских городов.
Архаизирующая стилистика произведения сочетается с элементами, привнесенными живой наблюдательностью иконописца, изображавшего с помощью условных приемов современную ему архитектуру: стену Кремля с шатриками на башнях, пятиглавый собор, многоярусную колокольню, крытые двускатной кровлей палаты. Памятником истории и первоклассным произведением искусства является икона «Спас Вседержитель с припадающими митрополитом Филиппом и патриархом Никоном». Созданная по заказу патриарха Никона в конце 1650-х - начале 1660-х годов, она входила в состав иконостаса Голгофского придела Воскресенского собора Новоиерусалимского монастыря. Отразившиеся в иконе идеи и конкретные исторические ситуации, несомненно, связаны с личностью заказчика - патриарха Никона. Строгая, лаконичная композиция иконы исполнена глубокого и многозначного смысла. В центре представлен сидящий на троне Вседержитель. К его стопам припадают изображенные в резко уменьшенном масштабе Филипп (слева) и Никон. Это сопоставление не случайно. Патриарх Никон не раз сравнивал свою судьбу с судьбой московского митрополита Филиппа (Колычева), за противодействие царю Ивану Грозному задушенного опричником Малютой Скуратовым. Тема безвинного страдания выражена в иконе двумя ангелами с орудиями страстей: крестом, копьем и тростью. Символизируя мученическую смерть Христа, эти изображения соотносятся и с фигурами припадающих. Коленопреклоненные позы Филиппа и Никона свидетельствуют о смирении и покорности, над фигурой последнего помещен текст покаянной молитвы. Митрополит и патриарх, гонимые земными царями, изображены в обращении к «царю небесному», чей величественный, блистающий золотым светом облик воплощает представления о высшей власти и высшей справедливости,
Икону «Спас Вседержитель с припадающими» отличает высокое живописное мастерство, выразившееся прежде всего в гармоническом единстве монументального образа и декоративных деталей. Мастерство исполнения, а также принадлежность заказчика к высшим слоям церковной иерархии позволяют предполагать, что этот памятник был создан в кругу царских и патриарших мастеров. В фондах музея хранится серебряный вызолоченный оклад иконы с гравированными изображениями богоматери и святых, украшенный жемчугом, яхонтами, алмазами, изумрудами. Первоначально икона находилась в несохранившемся резном кипарисовом киоте, створки которого, обложенные атласом и бархатом, также имели серебряный оклад. В целом это был великолепный ансамбль, гармонично объединявший живопись, резьбу по дереву, узорные ткани и ювелирные изделия из драгоценных металлов и камней.