В 1812 г. госпиталь разграбили, но правнуки Бориса Ивановича в 1820 г. вновь привели церковь в благолепный вид: украсили живописью, позолотили иконостас. Тогда же госпиталь переименовали в Странноприимный дом. В конце XIX в. храм практически превратился в самостоятельный приходской, и в его общине числилось более ста человек. Последний большой ремонт произвели в 1907–1909 гг., когда отреставрировали вызолоченный старинный четырехъярусный иконостас и стенопись (художник А.Н. Уханов и другие). В храме сохранялись многие церковные святыни и историко-мемориальные реликвии. При входе помещалась огромная икона преподобного Серафима Саровского в золоченом киоте. За южной дверью алтаря, против правого клироса – большой образ святителя Николая с чудесами и другая небольшая икона святителя Николая с мощами святого Автонома. Был еще один образ святителя Николая, и на нем в виде панагии – ковчег с частицами мощей святителя Николая, святителя Иоанна Златоуста, великомученика Георгия Победоносца и другой ковчежец с частицей мощей великомученицы Варвары. В трапезной близ Гребневской иконы Божьей Матери стоял старинный резной кипарисовый Крест Господень с предстоящими. Вокруг него в двадцати двух клеймах были изображены мелкой резьбы страсти Христа, а под ними в пятнадцати клеймах – Господские и Богородичные праздники.
1 августа 1918 г. храм был полностью отделен от богадельни и официально объявлен самостоятельным. В этом же году из Странноприимного дома призреваемые были переведены в другие богадельни. В 1930 г. Николаевский храм закрыли, и большинство его святынь прихожане перенесли в соседнюю церковь Иоанна Предтечи на Земляном валу. В 1931 г. храм разрушили.
Николая Стрелецкого, святителя, церковь
(уничтожена).Недалеко от Боровицких ворот Кремля, на улице Знаменка стоял один из самых типичных московских приходских храмов – Николы Стрелецкого, что у Знаменской решетки. Эту небольшую пятикупольную церковь построили в 1682 г. на месте более старой, известной с XVI века. Название храма «Стрелецкий» объясняется двояко. Возможно, здесь еще во времена царя Ивана IV Грозного жили стрельцы, и они были заказчиками и прихожанами первого, раннего храма. По другой версии, церковь стояла на стрелке, то есть здесь под острым углом сходились две улицы: Знаменка и Волхонка. Первоначально деревянный храм стоял на другом углу перекрестка, и был перенесен на правую сторону Волхонки, когда строили его в камне в 1682 г. Храм имел ряд декоративных кокошников, отделенных от фасадов карнизом. Трехчастная апсида выходила почти на приезжую часть Знаменки. В трапезной существовал придел великомученика Евстафия Плакиды – древнеримского полководца.
В 1807 г. разобрали старую трапезную и колокольню и к 1810 г. построили новые, в стиле классицизма. Но при этом фасады главного храма не изменили в угоду моде. Получилось очень красивое здание, хотя и разновременное, но гармоничное. В трапезной освятили приделы Богоявления Господня и святого Евстафия Плакиды. Церковь стояла на перекрестке улиц, своим изящным пятиглавием выделяясь на фоне больших домов, стоявших дальше по Волхонке и Знаменке. Она составляла единый ансамбль с домом Пашкова, возвышавшимся на другом углу Знаменки, и потеря этого ансамбля очень обеднила центр Москвы.
Никольский храм достоял до 1932 г. Сейчас на его месте небольшой косогор. Часть церковного участка отошла под проезжую часть, где идет поток машин со Знаменки на Большой Каменный мост. В 2000 гг. художник А.М. Шилов, имеющий картинную галерею в соседнем доме, расширил его, сделав пристройку, и при этом занял часть территории бывшего храма.
Николая, святителя, в Студенцах единоверческая церковь
(Таганская улица, дом № 20а).