В первые годы советской власти храм уничтожили почти полностью. Его обезображенный остов можно видеть с Большой Новодмитровской улицы. Место, где некогда находились многочисленные храмовые постройки, отмечает здание, являющееся остатком колокольни. В начале 1990-х годов силами верующих остатки колокольни были расчищены, и в ее нижнем ярусе в 1999 г. освящена церковь во имя святого благоверного князя Димитрия Донского (Бутырская улица, дом № 56).
Рождества Пресвятой Богородицы в доме князя Голицына церковь
(улица Волхонка, дом № 14; уничтожена).В 1738 г. домовладение на Волхонке было приобретено князем М.М. Голицыным, по заказу которого в 1759–1766 гг. архитекторы И.П. Жеребцов и И.С. Мегасов возвели двухэтажный главный дом, в основу которого был положен проект петербургского архитектора C.I4. Чевакинского. Домовая церковь Рождества Пресвятой Богородицы была освящена в 1766 г. в правом ризалите второго этажа. А. С. Пушкин, который бывал на балах, даваемых в собственном доме князем Сергеем Михайловичем Голицыным, предполагал венчаться в домовом храме князя. Но митрополит Филарет не благословил этот выбор, и венчание с Наталией Николаевной состоялось в церкви Вознесения Господня у Никитских ворот, в приходе которой жила семья Гончаровых. В середине XIX века в доме князей Голицыных действовал музей, посетители которого, по желанию хозяина, сначала молились на воскресной службе в домовом Рождественском храме, потом пили чай в кабинете, после чего осматривали музей.
Домовая церковь существовала и тогда, когда часть здания стала занимать фешенебельная гостиница «Княжий двор». В 1903 г. дом был куплен у Голицыных Московским обществом любителей художеств. Церковь была обновлена в 1902 г. по проекту архитектора К.М. Быковского, как писали тогда, «в готическом стиле, иконостас – в полуклассическом». В 1909–1910 гг. в доме размещался Народный университет имени Шанявского.
В 1918 г. церковь закрыли. Иконостас был отправлен в село Алексеевское. Возможно, речь идет о церкви Тихвинской иконы Божией Матери в Алексеевском. Здание перестроено, и в настоящее время его занимает Институт философии Российской академии наук.
Рождества Пресвятой Богородицы во Владыкине церковь
(Алтуфьевское шоссе, дом № 4).К 1596 г. относится первое письменное упоминание о деревянном храме святителя Николая в селе Вельяминове, на левом берегу реки Лихоборки. В 1653 г. село перешло во владение патриарха. Патриарх Никон переименовал его во Владыкино и освятил 9 апреля 1654 г. в нем второй храм в честь Иверской иконы Божией Матери. К 1682 г. относится первое письменное упоминание о храме Рождества Пресвятой Богородицы во Владыкине. Находился он на том же высоком левом берегу Лихоборки, что и храм святителя Николая. В 1701 г. он еще оставался деревянным. С упразднением патриаршества в 1722 г. император Петр I подарил Владыкино Феофану Прокоповичу. Двор его находился рядом с церковью Рождества Пресвятой Богородицы. Каменный храм был построен в конце XVIII века. Иконы в него были принесены из упраздненной церкви села Никольского. Строительство новой церкви началось в 1858 г. по проекту архитектора А.Ф. Ярошевского. Средства на строительсво пожертвовал предприниматель Г.М. Толоконников. 2 февраля 1859 г. освятили трапезную с приделами архангела Михаила (южный) и архангела Гавриила (северный). Главный престол в честь праздника Рождества Пресвятой Богородицы освятили летом 1860 г. Пятиглавый храм выстроен в классическом стиле с трапезной и шатровой колокольней. Храм стоял на холме, вокруг него, на двух берегах реки, располагалось село Владыкино. Невдалеке в овраге бил источник, издревле почитавшийся святым, с часовней над ним, уничтоженной в 1920-е гг. На месте патриарших палат в 1901 г. рядом с храмом была построена церковно-приходская школа.
На церковном кладбище была похоронена актриса Мария Николаевна Ермолова, ее родители и сестры. В 1930-е гг. кладбище полностью уничтожили, прах Ермоловой перенесли на Новодевичье кладбище. Вокруг храма сохранилась ограда XIX века и небольшая часовенка (капличка). Неподалеку (у дома № 8 по Алтуфьевскому шоссе), бьет источник, вода которого почитается как целебная.
Церковь никогда не закрывалась и сохранила чтимые иконы и святыни (Смоленская икона Божией Матери, иконы трех святых Василия Великого, святителя Николая Чудотворца и великомученицы Варвары с частицами мощей и другие). В ризнице хранится Евангелие конца XVII в. К этой церкви приписаны домовый храм святителя Николая Чудотворца в Отрадном и часовня великомученика Пантелеймона в Отрадном.
Рождества Пресвятой Богородицы Зачатьевского монастыря собор
(уничтожен).