Богоявленский монастырь – одна из древнейших московских обителей. Согласно археологическим исследованиям, проведенным в конце 1980-х гг., он возник на месте деревянного храма и погоста второй половины XIII в. Монастырь возник в конце XIII в., и, согласно легенде, был основан московским князем Даниилом Александровичем. При Иване Калите был построен каменный храм, создание которого стало делом московского тысяцкого Протасия, родоначальника боярского рода Вельяминовых. В дальнейшем Вельяминовы были ктиторами монастыря; здесь находилась их родовая усыпальница. В XIV в. в Богоявленском храме принял постриг боярский сын Елевферий, будущий – святой митрополит Московский Алексий; здесь же был игуменом и преподобный Стефан, старший брат Сергия Радонежского, духовник великого князя Семена Гордого, московского тысяцкого Василия Вельяминова и других старейших бояр.
В 1624 г. на месте храма XIV в. был построен новый, который, в свою очередь перестроили в современном виде в 1693–1697 гг. в стиле нарышкинское барокко. При этом прежний храм вошел в состав нового в качестве нижнего храма с приделом Казанской иконы Божией Матери. Монументальное здание собора представляет собой типичный для конца XVII в. храм типа «восьмерик на четверике», увенчанный одной главой и украшенный колонками, картушами, наличниками и др. В 1747 г. собор перестраивался, с северной стороны, под папертью верхнего храма был сооружен придел во имя Святого Георгия Победоносца, а в 1754 г. южный придел нижнего храма во имя св. апостола Иакова был обращен в ризницу. В 1904 г. на его месте освятили храм во имя святителя Феодосия Черниговского. Новый придел Тихвинской Божией Матери был создан в 1868 г. в верхнем храме, в 1873 г. в трапезной соорудили придел во имя великомученика Пантелеймона, в 1910 г. – в северо-восточной части верхней галереи был образован придел во имя Рождества Иоанна Предтечи. Небольшая, двухъярусная колокольня со шпилем была построена в середине XVIII в.
В 1680–1687 гг. в Богоявленском монастыре располагалась школа, которой руководили греки Иоанникий и Софроний Лихуды. Впоследствии она была переведена в Заиконоспасский монастырь и преобразована в Славяно-греко-латинскую академию. 31 мая 2007 г. в память о просветителях у ограды храма установлен памятник братьям Лихудам. В соборе частично сохранилось великолепное убранство, созданное итальянским мастером Д.М. Фонтана и его учениками в начале XVIII в. Это – три рельефа «Коронование Божией Матери», «Рождество» и «Крещение». На протяжении нескольких веков в Казанском храме с массивными столпами и низким потолком хоронили высшую московскую знать. На надгробных плитах можно было прочитать имена бояр и князей Голицыных, Шереметевых, Юсуповых, Салтыковых, Долгоруких. Надгробия собора были выполнены Ж.-А. Гудоном и другими выдающимися скульпторами XVIII в. (после закрытия храма перевезены в Михайловскую церковь Донского монастыря).
В 1920-е гг. монастырь был закрыт, уничтожены колокольня, Афонская часовня и монастырские строения, выходившие на Никольскую улицу. 1929 г. собор закрыли и вывезли из него все церковное убранство. В 1991 г. храм вернули общине верующих. Нижний храм был освящен во имя Казанской иконы Божией Матери с приделом святителя Алексия митрополита Московского, а верхний – во имя Богоявления с приставным престолом священномученика Владимира митрополита Киевского. При храме действуют Московская регентско-певческая семинария, Музыкальный педагогический лицей и воскресная школа.
Богоявления Господня в Дорогомилове церковь
(уничтожена).Первые документальные сведения о Богоявленском храме в Дорогомиловской ямской слободе, с приделом святителя Николая, относятся к 1620-м годам. В 1733 г. выстроили новое церковное здание. В 1835 г. к трапезной пристроили придел в честь иконы Божией Матери «Утоли моя печали». В 1862 г. храм капитально переделали, с северной стороны пристроили придел святителя Тихона Задонского, с южной – преподобного Сергия Радонежского, колокольня выросла на один ярус. В 1898 г. храм частично был разобран, и на его месте к сентябрю 1908 г. выстроили огромную церковь с четырьмя приделами (архитектор В.Е. Сретенский). Храм и его приделы украшали роскошные резные вызолоченные иконостасы оригинального рисунка, сооруженные П.А. Сизовым. В них и на стенах было размещено много икон XVIII века и высокохудожественные образа середины XIX века, исполненные иконописцами Палеха. Прихожанами особо почитался больших размеров Животворящий Крест Господень с изображением распятия, созданный мастером Е. Елкиным в XVII веке.
К середине 1920-х годов, после закрытия Чудова монастыря и передачи обновленцам храма Христа Спасителя, Богоявленская церковь в Дорогомилове стала кафедральным собором.