После того как британское правительство Рамсея Макдональда в мае 1939 года опубликовало «Белую книгу», ограничивавшую право евреев переселяться в Палестину, Иргун повернул оружие и против англичан. Помешав европейским евреям искать спасения в Палестине, англичане лишили их возможности избежать гитлеровских лагерей уничтожения.
В декабре 1941 года семьсот семьдесят два еврея сели на старенькое судно в Варне и вышли в море. Они добрались до Турции. Турецкие власти запросили Англию: если беженцам разрешат обосноваться в Палестине, они получат транзитные визы.
Англичане ответили отказом. Судно вышло в море и затонуло, из семисот человек в живых остались трое.
Командиром Иргуна стал молодой человек по имени Давид Разиэль. После начала Второй мировой войны Разиэль уведомил англичан, что объявляет перемирие в борьбе с британскими властями, потому что появился общий враг — Гитлер. Находившихся в тюрьме руководителей Иргун англичане выпустили на свободу. В ноябре 1940 года Иргун прекратил боевые операции.
Тогда от Иргуна откололась группа под руководством поэта Авраама Штерна. Он создал свою организацию Лохамей херут Исраэль (Борцы за свободу Израиля), сокращенно Лехи. Соратники Штерна исходили из того, что и нацисты, и англичане в равной степени остаются врагами, с которыми придется сражаться. Перемирия нет и быть не может.
Штерн еще до начала Второй мировой войны поехал в Польшу, где с помощью польской армии организовал военное обучение еврейской молодежи, желавшей уехать в Палестину.
Во время операции против пронацистского режима Рашида Али аль-Гайлани в Ираке британская разведка обратилась к Разиэлю за помощью. В мае 1941 года его попросили сформировать боевую группу, которая возьмется взорвать под Багдадом склад с горючим для немецких самолетов, доставлявших в Ирак оружие и военных советников.
Разиэль 17 мая погиб. Новым командиром Иргун цвай леуми стал Яков Меридор. В декабре 1943 года Иргун возглавил будущий премьер-министр Израиля Менахем Бегин.
В Иргун входило больше трех тысяч человек, в основном это были городские жители, выходцы из Польши и Йемена. В Хагане и Пальмахе большинство составляли эмигранты из России.
В начале 1944 года, когда исход Второй мировой войны был ясен, Иргун вновь объявил войну англичанам. Сначала бойцы Иргун уничтожили списки тех, кого британские власти собирались выслать из Палестины. Потом атаковали полицейские посты.
Однако Хагана и Пальмах продолжали помогать британским властям. Пальмах захватил главных руководителей Иргуна и интернировал их в один из кибуцев. Хагана поступила еще жестче — поймала некоторых командиров Иргуна и передала их англичанам. Хагана считала: пока идет война с нацистами, они с англичанами союзники и воевать на два фронта глупо.
С политической линией Иргуна многие палестинские евреи не соглашались, но уважали твердость, мужество и находчивость его бойцов. Например, будущий генеральный директор объединения промышленников Израиля Пелег Тамир за участие в террористической организации Иргун цвай леуми в августе 1945 года был приговорен англичанами к тюремному заключению. Он отсидел два года в тюрьме, и его перевели в концентрационный лагерь Атлит. Оттуда он бежал — его вынес в большом чемодане заключенный, чей срок закончился.
После окончания Второй мировой войны британское правительство по-прежнему не разрешало евреям переселяться в Палестину. 1 октября 1945 года Бен-Гурион отдал приказ Хагане поднять вооруженное восстание против англичан и помочь приезжающим из Европы евреям прибыть в Палестину. Он понимал, что еврейское подполье не в силах одолеть британскую армию, но надеялся привлечь внимание мировой общественности.
Бен-Гурион в запальчивости говорил тогда: «Действия нового британского правительства являются продолжением враждебной политики Гитлера».
Отряды самообороны осуществляли диверсии на железных дорогах и пускали ко дну корабли британской береговой охраны, которые перехватывали суда с беженцами. 16 июня 1946 года Хагана взорвала одновременно девять мостов.
Англичане ввели комендантский час. Евреи, задержанные с оружием в руках, приговаривались к пожизненному заключению. Устраивались массовые облавы, арестованных пытали, добиваясь, чтобы они выдали адреса командиров подпольных боевых организаций. 29 июня 1946 года британские войска обнаружили склады с оружием, принадлежавшие Хагане, и арестовали три тысячи бойцов Хаганы и Пальмаха.
В ответ боевики Иргуна провели несколько дерзких операций. Они нападали на британских солдат и офицеров, дерзко освобождали заключенных, захватывали оружие.
22 июля 1946 года Иргун взорвал южное крыло лучшей в Иерусалиме гостиницы «Царь Давид», где располагались чиновники британской администрации и военные. Гостиницу построили в 1930 году. Это была одна из главных достопримечательностей города. Всякий сколько-нибудь уважающий себя чиновник, бизнесмен, журналист или политик, приезжая в Иерусалим, останавливался только здесь.