С. П. Ванновскому, кроме того, также предписывалось пройти по маршруту от крепости Таш-Курган, расположенной на реке Бартанг, вверх по течению и произвести рекогносцировку путей из долины Бартанг в долину Язгулем, связав таким образом ранее неизвестные европейцам части Рушана и Дарваза. Преодолевая неимоверные трудности, небольшой отряд прошел по горному бездорожью и выполнил поставленную перед ним задачу.
А тем временем начальником Памирского поста был назначен капитан В. Н. Зайцев [29]
. Имея в своем распоряжении роту пехоты 4-го Туркестанского линейного батальона, до полусотни казаков, расчет двух пулеметов, взвод конно-горной батареи и под техническим руководством военного инженера А. Г. Серебренникова, в более удобном месте было воздвигнуто новое постоянное Памирское укрепление, получившее название Мургаб.Одновременно в 1894 году, в противовес британской активности в регионе, началось строительство в глубокой тайне секретной военно-стратегической колесной дороги на Памире через перевал Талдык высотою 3615 м, соединившей Ферганскую и Алайскую долины. Дорога строилась под руководством подполковника Б. Л. Громбчевского [30]
и была предназначена для оперативной переброски войск и артиллерии на юг в случае угрозы вторжения британцев в регион. Таким образом, Россия предупредила возможное появление англичан в Алайской долине, откуда Британия могла двинуться далее на север и выйти на оперативный простор Ферганского края. С завершением строительства стратегической дороги в Алайскую долину Россия получала передовой плацдарм для дальнейшего распространения своего военно-политического влияния в Центральной Азии. Тем самым территория Восточного Памира, на которой располагался и постоянный русский пост, прочно вошла в состав Российской империи, избавив население от постоянных афганско-маньчжурских набегов и британских притязаний.Однако население Западного Памира продолжало подвергаться насилию и постоянному грабежу со стороны афганцев. С целью предотвращения дальнейшей эскалации напряженности в этом районе летом 1894 года Россия направила на Памир специальный отряд под командованием генерал-майора М. Е. Ионова.
Передислокация большого количества афганских войск на Западный Памир заставила М. Е. Ионова разделить свой отряд на две рекогносцировочные группы, которые должны были обособленно спуститься по рекам Гунт и Шахдара до их впадения в Пяндж. Продвижению этих групп по неизведанным местам помогало местное население.
25 июня 1894 года военный отряд под командованием капитана А. Г. Скерского [31]
выдвинулся из Джавшангоза и начал спускаться вниз по Шахдаре. Недалеко от селения Барваза отряд встретили афганские войска, вчетверо превосходившие русских по численности. Это заставило А. Г. Скерского действовать осторожно и отступить к урочищу Верздара. Между тем лазутчики-таджики постоянно информировали русских, что к афганцам прибывает подкрепление.Афганские войска, зная о малочисленности русского отряда, вели себя вызывающе, но атаковать русских не решались.
В начале августа афганские войска начали медленно отступать вниз по реке и заняли оборону в крепости Рошт-Кала. 19 августа к Рошт-Кале начал подходить отряд генерала М. Е. Ионова. Узнав об этом, афганские войска начали поспешно отступать по реке к Хорогу, а затем через Пяндж перебрались на афганскую сторону.
В конце августа генерал М. Е. Ионов подошел к Хорогу, где встретился с отрядом подполковника Н. Н. Юденича [32]
, который с Восточного Памира по реке Гунт подошел к Хорогу. До 15 сентября генерал М. Е. Ионов провел две дополнительные рекогносцировки. Первую – до крепости Калаи Вомар в Рушане, вторую – вверх по реке Пяндж до местечка Кухи Лала. В результате со всех этих территорий афганские войска под натиском русских войск вынуждены были уйти в Афганистан.Однако после ухода русских войск в который раз афганские войска вновь перешли на территорию Западного Памира, чтобы насиловать, грабить, убивать. В сторону Восточного Памира потянулись вереницы измученных людей, которые у русских искали защиту и покровительство.
Для прекращения беспорядков, чинимых афганцами на Западном Памире, генералом М. Е. Ионовым было принято решение об отправке в Хорог, Рушан и Вахан офицерских разъездов. Узнав об этом, афганцы начали покидать Западный Памир.