Очень скоро недовольные составили заговор, который снова возглавил опытный Василий Шуйский. Он уже побывал в руках палача и вовсе не хотел еще раз оказаться перед плахой. Поэтому заговорщики действовали очень осторожно. В Польше они вошли в контакт с противниками Сигизмунда III и предложили им возвести Лжедмитрия на польский престол. Польский король довольно быстро узнал об этом, и отношения его с Лжедмитрием обострились до предела. Взбешенный король по дипломатическим каналам прямо заявил ему: «Подлинно тебя Бог сопхнет с столицы твоей, и надобе то указать всему свету и Москве самой, какой ты человек и что им хочешь сделати». Одновременно заговорщики распространяли слухи, что Лжедмитрий — царь не настоящий и готовили покушение. Лжедмитрий знал об этом и значительно увеличил свою охрану — теперь в Кремле постоянно дежурили сотни иностранных наемников. Однако для полной безопасности этого было мало, а на русских Лжедмитрий не рассчитывал. Тогда самозванец вспомнил о дочери Юрия Мнишека Марине, которую в свое время обещал взять в жены. По условиям этого брачного соглашения Мнишеку и его дочери обещаны были крупные земельные владения. Они же обязывались привести с собой в Москву наемников и оружие. Лжедмитрий пообещал каждому из солдат задаток в сто золотых.
2 мая 1606 года свадебный кортеж вступил в Москву. Невесту сопровождало столько вооруженных людей, что казалось, будто в город входит иноземная армия. Через несколько дней состоялась свадьба, которая вызвала страшное возмущение: мало того, что церемония проходила на польский манер, так невеста-католичка еще и отказалась принять причастие. Мало кто знал, что, как только собор покинули иноземные дипломаты и гости, Марина тут же обвенчалась с Лжедмитрием по православному обряду. Впрочем, к самой новобрачной в народе поначалу отнеслись благосклонно. Куда больше москвичей раздражали польские гусары, прибывшие вместе с Юрием Мнишеком. Те без колебаний пускали в ход оружие и затевали с горожанами драки и ссоры по любому поводу. Меньше чем через неделю по всему городу начали говорить, что царь — «иноземец», «поганый», ест нечистую пищу и оскверняет святыни. Поводов к тому было достаточно — Лжедмитрий обычаев православных не соблюдал, устроил свадебный пир в постный день, развратничал (о количестве его внебрачных детей ходили самые невероятные слухи).
14 мая начались первые волнения, а 17 мая народ восстал.
Лжедмитрий полагал, что главная опасность грозит лишь полякам и не принял достаточных мер безопасности. Он до самого конца не подозревал, что в заговоре против него замешаны его приближенные. До конца верен ему оставался лишь Петр Басманов, с дворцового Красного крыльца убеждавший народ разойтись. Но один из заговорщиков убил его ударом кинжала, и толпа ворвалась во дворец. Спасая свою жизнь, Лжедмитрий выпрыгнул из окна, но вывихнул ногу. Далеко уйти он не мог, и вскоре заговорщики его обнаружили. Тщетно самозванец умолял их дать ему поговорить с народом. Бояре набросились на него, сорвали царскую одежду и забили до смерти, после чего обнаженное и изуродованное тело выволокли из Кремля и бросили на площади в грязь, объявив, что это не царь, а беглый монах-расстрига Гришка Отрепьев.
На улицах Москвы в это время толпа расправлялась с поляками и со всеми чужеземцами, в недобрый час оказавшимися на улице. Погибло более 400 иностранцев, но и москвичей полегло немало — наемники дорого продавали свою жизнь и убили более 300 человек. Сотни людей были ранены. Марину Мнишек и ее отца оставили в живых, но дочиста ограбили. Позже их сослали в Ярославль. Погромы, вероятно, инициировались боярами, потому что уже к вечеру власти восстановили порядок.
Через три дня царем «выкрикнули» Василия Шуйского.
Пока знать пыталась договориться, «малые некий от царских палат» составили грамоту об избрании Василия на царство и сопроводили его на Лобное место. Москвичи встретили Шуйского одобрительными возгласами.
В день своего восшествия на престол Шуйский распорядился убрать труп самозванца. Тело Лжедмитрия привязали к лошади, выволокли в поле и закопали у обочины дороги. По городу, однако, ходили разные слухи. Появлялись «прелестные письма», подписанные чудом спасшимся Лжедмитрием, говорили, что из могилы его вырывается голубое пламя. К тому же вдруг наступили невиданные холода и пожухла вся зелень… Обеспокоенное духовенство распорядилось выкопать труп «колдуна» и сжечь.
Гражданская война