Что касается Германии, то здесь на первом этапе ситуация складывалась не слишком удачно для французов. 30 августа Бернадотт, которого подталкивал к активным действиям смелый генерал Фридрих Вильгельм Бюлов, двинул свои войска на юг, к Виттенбергу. Силы Удино ослабил уход VII корпуса Ренье, который должен был укрепить войска Вандамма. Не имея возможности вступить в открытое сражение, Удино отошел за Эльбу, разместив в Виттенберге свой штаб. Он немедленно сообщил маршалу Даву о своем тяжелом положении. «Железный маршал», в распоряжении которого находились 27 000 человек, тотчас двинул свои силы против Вальмодена, имевшего 25 000 солдат. Последний отошел на юго-восток и сообщил Бернадотту, что не сможет остановить Даву, если не получит подкреплений. Бернадотт отказался от планов форсирования Эльбы и направил для поддержки Вальмодена две дивизии. Тем временем Даву энергично продвигался вдоль восточного берега Эльбы и соединился с флангом Удино в Магдебурге. Однако Вальмоден, получив подкрепление, смог остановить продвижение Даву. Таким образом, к 4 сентября обстановка на северном театре военных действий стабилизировалась и противники удерживали позиции на противоположных берегах Эльбы. Между тем Бернадотт, узнав о разгроме Богемской армии, не испытывал желания предпринимать какие-либо дальнейшие наступательные действия.
Когда Блюхер узнал, что Наполеон, взяв гвардию, 25–26 августа отправился к Дрездену, решил нанести удар по группировке Макдональда, чтобы поддержать Богемскую армию. 29 августа на берегах реки Бодер генерал Блюхер вступил в боевое соприкосновение с войсками Макдональда. Последний, зная о победе при Дрездене, сообщил Наполеону о наступлении Блюхера, а также попросил новых указаний и подкреплений. На исходе того же дня Блюхер узнал о поражении Шварценберга, однако ему сообщили, что Богемская армия отступила, сохранив боевой порядок. Имея в своем распоряжении 87 000 человек, прусский генерал решил атаковать Макдональда, пока силы Наполеона связаны боями с армией Шварценберга. 31 августа он ускорил переправу через Бодер севернее Бунцлау. Однако Макдональд не стал вступать в сражение с превосходящими силами противника, а отступив за реку Квайс, вновь занял оборонительную позицию. Лишь 2 сентября Блюхер смог форсировать разлившуюся после дождей реку. Макдональд снова отступил на запад, призывая Наполеона срочно оказать ему поддержку. Наполеон не испытывал желания распылять свои силы до того, как капитулирует Шварценберг, поэтому Макдональд получил приказ удерживать свои позиции как можно дольше, а затем отступать как можно медленнее. Блюхер, форсировав Квайс, атаковал силы Макдональда. Французы оказали упорное сопротивление, а затем, сохраняя боевые порядки, 3 сентября отошли к Гёрлицу, расположенному на берегу реки Нейсе. На следующий день Макдональд получил от Наполеона известия о том, что Мортье, а вслед за ним Вандамм наконец выступили на север с целью оказать ему поддержку.
4 и 5 сентября Макдональд продолжал отступать, подвергаясь энергичным атакам Блюхера и ожидая подхода сил Мортье и Вандамма, без поддержки которых не мог вступить в сражение с противником. Шестого сентября Блюхер уже знал о масштабах катастрофы, постигшей Богемскую армию. Лишь генерал Клейст, спасшийся на восточной стороне Эльбы, ушел от преследования и теперь обладал свободой маневрирования. Он двигался на юг, в направлении Праги. 7 сентября Мортье соединился с Макдональдом, который, находясь в Баутцене, готовился к обороне реки Шпрее. Блюхер зная о прибытии Мортье, теперь был обеспокоен тем, что его левый фланг не защищен от французских войск, возвращающихся на север. Но он успокоился, когда получил известия о том, что Наполеон идет в Прагу. Блюхер считал, что французский император движется на юг со всеми своими силами и что ему придется иметь дело лишь с Макдональдом и Мортье.
Вторая битва при Баутцене
8 сентября прусская армия заняла выгодную позицию на восточном берегу Шпрее. А еще ночью войска Мортье в количестве 15 000 человек соединились с силами Макдональда, увеличив численность французской армии до 90 000 солдат. Им противостояли примерно 92 000 пруссаков. Тем временем I корпус Вандамма (теперь без 42-й дивизии) находился примерно в двенадцати милях юго-восточнее Баутцена. План французов был прост. Макдональд, форсировав Шпрее, должен был атаковать фронт позиции Блюхера, а Вандамм – нанести удар в тыл противника.