28 сентября была предпринята попытка отправить в космос корабль «7К-Л1» № 4. Намечалась работа по штатной программе полета к Луне с фотографированием Земли и ее спутника, но без участия экипажа. Попытка также не увенчалась успехом — подвела первая ступень ракеты «УР-500К». Зато впервые штатно отработали система аварийного спасения и система посадки, то есть в предназначенных для этих систем условиях аварийного пуска ракеты-носителя они обеспечили спасение спускаемого аппарата. Он приземлился среди зловещего желто-коричневого облака из паров азотного тетраксида и гептила — это было все, что осталось от «Протона». И хотя сам СА стоял на холме и не был подвержен воздействию ядовитых паров, подойти к нему не было никакой возможности. Этот случай выявил огромные трудности с обеспечением безопасности космонавтов, если бы они стартовали в космос на «Протоне». При более глубоком изучении проблема оказалась столь серьезной, что в качестве выхода из нее был предложен раздельный старт лунного корабля без экипажа на этой ракете, а космонавтов — на «семерке». На орбите предполагалась стыковка и переход людей в корабль «7К-Л1».
При запуске 22 ноября пятого экземпляра корабля подвела вторая ступень PH — один из четырех ее двигателей не вышел на режим. Ракета стала заваливаться в сторону, и система безопасности выключила двигатели. Вновь пришлось отработать своё системам аварийного спасения и посадки, правда, на этот раз из-за сбоев в работе оборудования двигатели мягкой посадки СА отработали на высоте 4,5 км. В итоге посадка приблизительно в 80 км юго-западнее Джезказгана получилась довольно жесткой, а ракета упала примерно в 300 км от места старта.
«7К-Л1» № 6, представленный широкой публике как «Зонд-4», был запущен 2 марта 1968 г. Программа полета на этот раз не предусматривала облет Луны, а ограничивалась полетом по очень вытянутой эллиптической орбите с максимальным удалением от Земли на расстояние не менее 300000 км. При этом все бортовые системы корабля должны были работать по программе, максимально приближенной к штатному облету Луны, а возвращение на Землю предусматривалось по траектории управляемого спуска. В течение 7 суток системы корабля работали, в основном, нормально. Тем не менее, из-за загрязнения еще при старте объектива звездного датчика система ориентации не смогла развернуть корабль нужным образом, и в плотные слои атмосферы СА вошел по неуправляемой (баллистической)траектории. Посадка его могла произойти вне территории СССР, и над Бискайским заливом система аварийного подрыва объекта (АПО) ликвидировала его.
Об этой системе надо сказать отдельно. Дело в том, что запуски советских космических аппаратов почти всегда преследовали интересы не только научных ведомств, но и Министерства обороны, и этот факт обязательно накладывал отпечаток на их конструкцию. В некоторых случаях научные и военные аппараты были связаны общим происхождением. Так, на основе беспилотного спутника-разведчика «Зенит-2» конструкторы ОКБ-1 на основании Постановления ЦК КПСС и Совмина СССР № 569–264 от 22 мая 1959 г. сделали пилотируемый корабль «Восток». Когда рассматривался вопрос комплектации «Востока», на котором должен был лететь Ю.А.Гагарин, было принято решение снять с него систему подрыва. Против этого возражал лишь один человек — первый заместитель Председателя КГБ СССР П.И. Ивашутин, соблюдение секретности выполняемых работ для этого ведомства было главным делом. Поэтому нет ничего удивительного, что на беспилотных кораблях «7К-Л1» и «7К-ОК» система АПО была установлена.
Запуск корабля «7К-Л1» № 7 состоялся 23 апреля 1968 г. На орбиту он не вышел из-за прохождения команды «Авария системы автономного управления» после сброса головного обтекателя: из-за конструкторской ошибки шина питания преобразователей замкнулась на корпус. САС и система приземления обеспечили нормальное возвращение спускаемого аппарата корабля на Землю.