В РГИА находятся архивы различных министерств, занимавшихся внутренней политикой, включая Министерство финансов (в частности, фонд 560). Поскольку это ведомство в пору, когда им руководил Сергей Витте, играло ведущую роль в царской авантюре на Дальнем Востоке, его архивы заслуживают особого внимания. Фонд 1622 (личные бумаги Сергея Витте) и фонды 1070 и 1072 (князя Эспера Ухтомского) представляют собой еще две важные коллекции.
Флот также активно участвовал в дальневосточных делах. В РГА ВМФ хранятся документы адмирала Евгения Алексеева (фонд 32) и Главного штаба флота (фонд 417). Исследователи найдут богатый материал в обширной коллекции дневников, мемуаров и других документов, собранных командованием флота для официальной истории войны (фонд 637). Богатой коллекцией важных источников могут также похвастаться два архива системы Российской академии наук: архив ее Санкт-Петербургского филиала и Научный архив Русского географического общества. В последнем хранятся бумаги Николая Пржевальского.
Москва
Фонд 133 — Канцелярия МИД
Фонд 137 — Отчеты МИД России
Фонд 138 — Секретный архив министра
Фонд 143 — Китайский стол
Фонд 543 — Коллекция рукописей Царскосельского дворца
Фонд 568 — Ламздорф В.Н.
Фонд 601 — Николай II
Фонд 640 — Александра Федоровна
Фонд 642 — Мария Федоровна
Фонд 645 — Александр Михайлович
Фонд 662 — Ксения Александровна
Фонд 677 — Александр III
Фонд 681 — Алексей Александрович
Фонд 713 — Бадмаев П.А.
Фонд 165 — Куропаткин А.Н.
Фонд 400 — Главный штаб, Азиатская часть
Фонд 401 — Военно-ученый комитет Главного штаба
Фонд 447 — Китай
Фонд 2000 — Главное управление Генерального штаба
Фонд 75 — Голицын В.М.
Фонд 169 — Милютин Д.А.
Фонд 363 — Венюков М.Н.
Санкт- Петербург
Фонд 208 — Ольденбург С.Ф.
Фонд 775 — Васильев В.П.
Фонд 13 — Ученый архив, Пржевальский Н.М.
Фонд 560 — Общая канцелярия министра финансов
Фонд 632 — Русско-китайский банк
Фонды 1070, 1072 — Ухтомский Э.Э.
Фонд 1273 — Комитет Сибирской железной дороги
Фонд 1622 — Витте СЮ.
Фонд 32 — Алексеев Е.И.
Фонд 417 — Главный Морской штаб
Фонд 763 — Дневники, заметки, записки, вырезки из газет о Русско-японской войне.
Фонд 314 — Ухтомский Э.Э.
Фонд 590 — Позднеевы Д.М. и А.М.
Нью-Йорк
Lev Pavlovich Urusov Papers Sergei Julevich Witte Papers
«Гражданин» (Санкт-Петербург)
«Новое время» (Санкт-Петербург)
«Новый край» (Порт-Артур)
«Россия» (Санкт-Петербург)
«Санкт-Петербургские ведомости» (Санкт-Петербург)
«Жизнь в восточной окраине» (Чита)
«North-China Herald» (Shanghai) «Times» (London)
Дипломатическое собрание дел между российским и китайским государствами с 1619 до 1792 года / Сост. Д.Н. Бантыш-Каменский. Казань: Типография императорского университета, 1882.
Сборник договоров и других документов по истории международных отношений на Дальнем Востоке (1842—1925) / Сост. Э.Д. Гримм (Труды Московского института востоковедения им. Н.Н. Нариманова. Т. VI). М., 1927.
Документы, касающиеся переговоров с Японией в 1903-1904 годах / Особый комитет Дальнего Востока. СПб.: Санкт-Петербургская синодальная типография, 1905.
За кулисами царизма: Архив тибетского врача Бадмаева / Ред. В.П. Семенников. Л.: Государственное издательство, 1925.
Китайская Восточная железная дорога. Сборник документов. Харбин: К.В.Ж.Д., 1922.
Международные отношения в эпоху империализма. Документы из архивов царского и Временного правительств. М., 1931.
Русско-китайские отношения 1689—1916: Официальные документы / Ред. B.C. Мясников, П.Е. Скачков. М.: Восточная литература, 1958.
Русско-китайские отношения в XVII веке: Материалы и документы / Ред. С.Л. Тихвинский. М.: Наука, 1972. Т. 2.