Вместе с войсками в подготовке и проведении этого решающего победного наступления участвовали партизанские соединения, в рядах которых сражались ленинградские чекисты. В период наступательных операций наших войск сотрудники 4-го отдела (разведотдела) передали Военному Совету Ленинградского фронта подробную схему укреплений Нарвского и Псковского оборонительных узлов противника, направили свыше 400 специальных разведывательных сообщений.
С начала 1942 года Ленинградским Управлением госбезопасности было подготовлено и направлено в тыл противника 50 оперативных работников, 186 разведывательно-диверсионных групп общим количеством 1090 человек. Всего за годы войны разведывательно-диверсионные группы совершили 300 диверсионных актов. Они подорвали 71 эшелон, уничтожив при этом 65 паровозов, 768 вагонов и платформ, 1 бронепоезд, 30 мостов, подожгли и взорвали 101 склад, в том числе 9 баз с горючим, расстреляли 1160 предателей и изменников Родины, уничтожили десятки тысяч солдат и офицеров противника. В результате агитационной работы среди личного состава сформированных фашистами воинских частей в партизанские бригады перешло свыше пяти тысяч человек.
После полного снятия вражеской блокады Ленинграда сотрудники военной контрразведки продолжали вести агентурно-оперативную работу в наступавших частях Ленинградского фронта. Они занимались выявлением и разоблачением агентов противника и его пособников, оставшихся на освобожденной территории. Основная тяжесть работы по розыску вражеских агентов легла на оперативный состав Ленинградского Управления госбезопасности. Только с января 1944 по май 1945 года ленинградские чекисты выявили и арестовали несколько сот агентов фашистских спецслужб.