Отец Н. А. Зарудного, Алексей Андреевич (21 мая 1826 – 5 января 1885), состоял на военной службе в Кирасирском великой княгини Марии Николаевны полку. Выйдя в чине ротмистра в отставку, занялся литературными трудами. В 1860-х годах он вместе с братом Николаем Андреевичем издавал газету «Петербургский Листок» (1866–1870 гг.), по результатам публикаций в которой пришлось вести судебные процессы, давшие ему печальную известность. Жил с женой в Петербурге широко открытым домом. Отличался страстной, неуравновешенной натурой, был азартным картежником и не оставил своему потомству никакого состояния. Погребен на Никольском кладбище Александро-Невской лавры в Петербурге.
Мать – Евдокия Николаевна, добрейшая, но малообразованная женщина, после смерти мужа вернулась в с. Гряково. Умерла 23 июня 1908 года.
Село Гряково Банковского уезда Харьковской губернии (в настоящее время Полтавская область, Украина) возникло в начале XVIII века. Владела им семья Куликовских. С 1835 года оно перешло к дочери Н. М. Куликовского Софье Николаевне – жене подпоручика Алексея Андреевича Зарудного. С этого времени с. Гряково и окружающие села принадлежали роду Зарудных, распоряжалась ими Вера Андреевна, сестра Алексея Андреевича, у которой при дер. Гряково-Софьевка было 846 десятин земли.
У Зарудных двое сыновей. Старший, Алексей (1856–1918), получил образование в Елисаветградском кавказском юнкерском училище, был холост, дослужился до подполковника Пограничной стражи, участвовал в кавказской кампании 1877–1878 годов, награжден орденами и медалями, расстрелян большевиками в Киеве в 1918 году. Своему младшему сыну Николаю родители уделяли мало внимания, и мальчик все детство провел на родине, в имении дяди и тети.
Николай Алексеевич Зарудный родился 13 (26 по новому стилю) сентября 1859 года. До 11 лет воспитывала его незамужняя тетя, Вера Андреевна Зарудная, последняя помещица с. Гряково. Немалое влияние на интерес к природе оказал и дядя, Николай Андреевич. Николай Алексеевич Зарудный пишет об обыкновенной чечевице:
Как вспоминали старожилы, «у гряковских помещиков Зарудных барщина доходила до шести дней на неделю, а труд длился от восхода до заката солнца». В 1854 году отец, Алексей Андреевич Зарудный, выиграл в карты сорок семей у помещика села Буково-Медведского Данковсько-го уезда Рязанской губернии. Переселенным в Гряково крестьянам пришлось жить в землянках и сараях. Но их ожидала новая беда: через пару лет Зарудный продал 33 семьи в Барвенковський уезд.
Социально-экономическое положение крестьян Полтавской и Харьковской губерний в следующее десятилетие, после отменившей крепостное право реформы 1861 года, было чрезвычайно тяжелым. Малоземелье, обременительные выкупные платежи, многочисленные налоги и тяжелая эксплуатация полукрепостничества приводили к разорению и упадку крестьянских хозяйств. Из года в год росли количество безземельных и малоземельных крестьян, а также таких, которые не имели ни рабочего, ни производительного скота. Крестьяне-крепостные по всей стране не мирились со своим положением. Учащались подпалы помещичьих имений, физические расправы над помещиками. Происходили и массовые выступления. Ощутимо это было и в имениях Зарудных, где был жестокий управитель.
Детство и учеба