Дальнейшее обострение борьбы с национальным подпольем произошло после того, как Красная Армия освободила остальные области Западной Украины: Львовскую, Дрогобычскую, Станиславскую и Черновицкую. При этом часть формирований УПА устремилась перейти с территории этих областей и даже из Польши в ранее освобожденные районы Волынской, Тарнопольской и Ровенской областей. Оуновцы производили на территории восточной Польши мобилизацию украинской молодежи, начиная с 17-летнего возраста, а на Западной Украине захватывали призывников Красной Армии. В составе формирований УПА воевали не только украинцы. Немало было и бывших военнопленных других национальностей. Так, в донесении наркома внутренних дел УССР B.C. Рясного о ликвидации 27 ноября в Тернопольской области остатков куреней «Романа» и «Ястреба» сообщалось: «Среди убитых много казахов, узбеков и русских» (ГАРФ, Ф. Р-9401, Оп. 2, Д. 68, Л. 21). Как отмечалось в очередном докладе Берия: «Бандиты ведут пулеметный и винтовочный огонь, а также огонь из минометов организованно и продуманно. Банды организуют оборону, отрывают окопы и ходы сообщения в полный профиль и в ряде мест сооружают дерево-земляные укрытия. Участники большинства разгромленных банд одеты в немецкую форму обмундирования, а также в красноармейскую форму».
Для борьбы с оуновским подпольем на Украину был вновь командирован зам. наркома внутренних дел СССР С.Н. Круглов. Пик вооруженных антисоветских выступлений пришелся на середину августа 1944 г., когда на освобожденной территории была объявлена мобилизация в Красную Армию призывных контингентов. В этот период (с 10 августа по 5 сентября 1944 г.) было проведено 853 чекистско-войсковых операции. Во всех районах Львовской области и прикарпатских районах Станиславской, Дрогобычской и Тарнопольской областей была проведена сплошная проверка населенных пунктов и проческа лесных массивов. Операции проводились силами внутренних и пограничных войск НКВД, войск НКВД по охране тыла 1 и 4 Украинских фронтов, милиции и оперативного состава НКВД. Так, с 22 по 27 августа в операции по очистке Рава-Русского, Угновского, Магеровского, Немировского и Яворовского районов Львовской области участвовали шесть пограничных полков войск по охране тыла 1-го Украинского фронта, пять пограничных отрядов войск Украинского пограничного округа и три полка (два стрелковых и один кавалерийский) Красной Армии, специально на период операции выведенные с передовой (На страже границ отечества: Пограничные войска России в войнах и вооруженных конфликтах XX в. — Третий том. — М., 2000. — С. 363). В результате проведенных операций убито 11076 и захвачено живыми 10892 человека (в числе убитых и раненых оказалось 126 немцев), задержано уклоняющихся от призыва в Красную Армию 9304 человека.
Неравенство вооруженных сил и большие потери (хотя в приказе командования УПА «Запад» № 9/44 утверждалось «Вражеские потери обычно в десять раз больше собственных» — доклады НКВД приводят прямо противоположное соотношение потерь) вынудили командование националистов издать 10 октября «Инструкцию для руководства генеральных округов», в которой предписывалось «От регулярно-военных форм борьбы перейти к боевым диверсионным формам». Вместе с тем приложение к приказу № 9/44 от 25 ноября 1944 г. указывало: «Сосредоточивать силы, а не раздроблять их, ибо расчленение сил с целью наилегшего выхода из-под облавы, не дает хороших результатов, а часто становится гибельным для партизанской части» (док. № 76)
Ряд крупных операций был проведен после задержания активистов ОУН-УПА. Так, 18 октября на основе данных агентуры был арестован начальник разведывательного отдела штаба Станиславского военного округа УПА Сильвестр Маланюк (кличка «Дуб»). 31 октября, на основании показаний Маланюка была проведена чекистско-войсковая операция, в результате которой разгромлены 2 лагеря куреней «Гамалия» и «Резуна», убито 177 и захвачено 48 оуновцев (док. № 59).
14 октября во время проведения операции на участке 14-го погранотряда войск НКВД Прикарпатского военного округа был задержан преподаватель школы младшего и среднего командного состава УПА, который дал показания о местонахождении школы общей численностью до 250 человек, непосредственно подчиненной главному штабу УПА. 15 октября в районе размещения школы была проведена операция, в результате которой школа была разгромлена. Убито 185 человек, в том числе начальник школы, захвачено живыми 5.
В декабре 1944 г. на основании агентурных данных была проведена операция в селе Нестаница Тогальского района. Захваченный взводный командир УПА Ленчук показал, что в селе Рожджау Радеховского района Львовской области находится какой-то штаб УПА. 13–14 декабря село было взято штурмом частями 2-го погранотряда и 42-го погранполка НКВД, при этом в ходе упорного боя убито 146 националистов и захвачено 5. Оказалось, что в селе действительно размещался штаб военного округа УПА «Буг», который объединял все вооруженные силы УПА на территории Львовской области (док. № 69).