Разные религиозные миссии были и представителями разных европейских держав. Протестантские организации действовали в интересах Англии и Германии, католические – в интересах Франции, Португалии и т. д. Показателен пример борьбы духовных миссий при дворе короля Буганды
, которая приняла острый характер. В 1870-х годах в Буганде и особенно при дворе правителя большим влиянием пользовались арабы. Король Буганды Мтеза носил арабский костюм, читал Коран, часть его подданных приняла ислам. Христианские миссионеры пытались подорвать влияние арабов и ислама в стране, но не могли прийти к единству действий. Католики убеждали короля, что протестанты исповедуют ложную религию, а те в свою очередь не оставались в долгу и всячески старались очернить католиков.С конца 1860-х годов Ватикан
проводит организационное укрупнение католических миссий, создает ряд новых религиозных образований, меняет тактику в поведении и деятельности миссионеров. В 1868 г. папский престол учреждает миссионерскую префектуру Сахары и французской Западной Африки. Одновременно создаются мужское и женское Общества миссионеров Африки, получивших названия «К концу XIX в. число обращенных в христианство африканцев по отношению к общему количеству населения по-прежнему было невелико. Однако влияние религиозных миссий определялось не столько числом неофитов, сколько сказывалось на жизни родовой общины, на размывании ее устоев. Не редкими были случаи, когда новообращенные выделялись из «языческой» общины, образуя отдельные поселения, и тогда она раскалывалась территориально. Чаще имело место другое: обращенные в христианство продолжали совместное проживание с «язычниками» в рамках общины, семьи, что, в свою очередь, неизбежно порождало внутри многочисленные конфликтные ситуации.
Вожди племен, допустивших христианские миссии в свои владения, вскоре обнаруживали опасные для себя и своих обществ тенденции. Обманутые обещаниями благополучия, обеспокоенные интригами «святых отцов», некоторые из правителей стали предпринимать радикальные меры по пресечению деятельности миссий, вплоть до их закрытия. Так было, например, в Иджебу
, Абеокуте (Нигерия), в Буганде и других местах. Деятельность миссионеров имела не только религиозный, но и политический характер. Насаждение христианства в целях борьбы с «Берлинская конференция 1884–1885 гг.
Основная борьба на конференции развернулась между главными участниками завершения раздела Африки – Англией
, Францией и Германией. В качестве стран, отстаивавших свои особые интересы, выступали Португалия и Бельгия. Помимо глав государств участие в форуме приняли и деловые люди европейских стран. Это свидетельствовало о том, что африканская экспансия была для европейских держав не только средством удовлетворения имперских амбиций, но и непосредственно затрагивала конкурентоспособность европейских и американских фирм.