Массовое недовольство верующих непомерной алчностью и политическим интриганством многих католических иерархов было лишь одном из факторов, способствовавших зарождению реформационного движения. Папская курия в качестве наднационального центра влияния и важнейшей силы, формирующей общественное сознание, была прежде всего потеснена в политическом и идеологическом отношениях централизованными национальными государствами Европы. В раздробленной же Германии этот фактор действовал гораздо в меньшей степени. Поэтому оппозиция католической церкви была очень широкой и включала в себя и светских князей, и представителей бюргерства, и народных проповедников. Претензии к церкви, формулируемые идеологами немецкой Реформации, простирались от необходимости секуляризации богатейших церковных имуществ до преобразования всей социальной структуры феодального общества на началах равенства. Основное возмущение в массах вызывали постоянно возрастающие церковные поборы, которые прочно ассоциировались с торжествующим духом наживы и забвением «истинных» евангелических принципов. Символом стяжательства церкви стала продажа индульгенций (лат. Indulgentia – «снисходительность», «милость»). Этот документ являлся особой грамотой об «отпущении грехов», выдаваемой церковью от имени Папы Римского за деньги или за какие-либо заслуги перед ней.
Толчок к окончательному складыванию реформационного движения в Германии дало выступление Мартина Лютера (1483–1546), посвященное именно практике индульгенций. Выходец из семьи горного мастера, Лютер получил образование в Эрфуртском университете, где на него оказали сильное влияние ученые-гуманисты. Будучи горячо верующим человеком, уверенным в своей греховности, он на время уходил в монастырь, но, разочаровавшись в монашестве, вернулся в мир, став преподавателем теологии в Виттенбергском университете.
В 1517 г. в Германию прибыли посланцы Папы с намерением распространять индульгенции. 31 октября 1517 г. Лютер прибил на дверях университетской церкви Виттенберга «95 тезисов против индульгенции». Тезисы в целом носили умеренный характер. Они тщательно устанавливали различия между «истинным значением папского отпущения грехов» и произволом «проповедника, продающего индульгенции». В документе указывалось на то, что всякая раздача каких бы то ни было индульгенций без предшествующего ей покаяния противна христианскому вероучению.
В тезисах Лютера, еще достаточно противоречивых, уже наметились основы его нового учения, принципы которого он углубил и обосновал в последующих работах. Сущность его взглядов можно свести к трем основным положениям. Во-первых, человек спасается только верой; во-вторых, она обретается только через милость божию и не зависит ни от каких заслуг человека; в-третьих, только Священное Писание, слово божие, является авторитетом в делах веры. Своими идеями Лютер ставил под сомнение роль церкви, как посредника между Богом и верующими. Он отрицал обязательный для католика авторитет Священного Придания, т. е. установлений церкви на основе решений Папы и соборов. Не признавая роли духовенства в качестве высшего религиозного авторитета, Лютер, однако, не подвергал сомнению функции церкви как наставницы людей в религиозной жизни, которая должна помогать человеку в разъяснении христианского учения и способствовать его «смирению» в повседневном поведении. Однако для этого церковь должна была стать по истине «евангелической», т. е. основанной на важнейших положениях Священного Писания.
В феврале 1518 г. Лютер написал объяснение к своим тезисам против индульгенций. В них он призывал верующих повиноваться властям, в том числе и Папе, но указывал, что на дела веры эта обязанность не распространяется. Положения, высказываемые Лютером, дали повод для возбуждения церковной инквизицией судебного процесса против него на основе канонического права и обвинения его в ереси. Противники Лютера добились решения о доставке его в цепях в Рим, но в дело вмешался саксонский курфюрст Фридрих Мудрый, один из влиятельнейших князей Германии и возможный кандидат в будущем на императорский трон, что остудило на время решимость папской курии.