С лета 1946 г. ситуация в Германии стала быстро обостряться. В июле государственный департамент США объявил о намерении объединить американскую и британскую оккупационные зоны для обеспечения эффективности административного управления. Соглашение об образовании «экономической объединенной области» (Бизонии) было подписано в декабре 1946 г. В рамках объединенных оккупационных зон начала проводиться более скоординированная политика, направленная на восстановление экономической инфраструктуры, потребительского рынка, сбалансированного рынка труда. Значительную роль в этом процессе играли уже немецкие административные органы, в том числе Экономический Совет, а в его составе – Управление экономикой под руководством Л. Эрхарда. Все эти меры предпринимались без координации со СВАГ.
Разную направленность приобрели и политические изменения в восточных и западных землях Германии. Первоначально этот процесс происходил в русле Потсдамских соглашений. Последовала ликвидация НСДАП и ее «дочерних» организаций, германских вооруженных сил, офицерского корпуса, полувоенных организаций. К участию в политической деятельности и замещению гражданских должностей допускались лишь лица, «способные по своим политическим и моральным качествам помочь развитию демократических учреждений в Германии». В соответствии с принципами гражданского, расового, национального равноправия была реорганизована судебная система. В ноябре 1945 – октябре 1946 г. происходила работа Международного трибунала в Нюрнберге, в ходе которого к ответственности были привлечены нацистские и военные преступники. Создавалась система местных немецких комиссий по денацификации (шпрухкаммер), которые вместе с трибуналами союзников определяли степень виновности подозреваемых. Всего было выделено пять категорий таких дел («главных виновников», «обремененных виной», «менее обремененных», «попутчиков» и «незатронутых»). Уголовное наказание предполагалось преимущественно для первой категории, поэтому 95 % обвиняемых были оправданы или лишь частично поражены в правах.
Процесс денацификации и демократизации сочетался с формированием обновленной немецкой политической элиты. В восточной и западных зонах партийное строительство приобрело значительную специфику. Советская администрация разрешила в 1945 г. деятельность в восточногерманских землях четырех партий – Коммунистической партии Германии (КПГ), Социал-демократической партии Германии (СДПГ), Христианско-демократического союза (ХДС), Либерально-демократической партии Германии (ЛДПГ). Уже в 1948 г. при поддержке СВАГ были созданы Национально-демократическая партия (НДП) и Демократическая крестьянская партия (ДКП), призванные расширить социальную базу левого блока. Под влиянием СВАГ коммунисты получили преимущество при подборе кадров для новой полиции и судебно-прокурорских органов в советской зоне. КПГ оказывала решающее влияние на ход радикальной реформы системы образования, регламентацию деятельности творческой интеллигенции, выступила с инициативой аграрной реформы. В руководстве КПГ существовало сильное леворадикальное крыло под руководством Вальтера Ульбрихта, отстаивавшее ортодоксальные идеологические принципы и необходимость социалистического строительства в Германии. Лидер КПГ Вильгельм Пик занимал более умеренную позицию, заявляя в 1945–1946 гг. об ориентации партии на создание парламентской демократической республики в масштабах всего немецкого государства.
Еще более жесткой была борьба леворадикального и умеренного течений в СДПГ. Первое из них возглавил берлинский Центральный комитет во главе с О. Гротеволем, второй – ганноверское бюро партии под руководством К. Шумахера, поддерживаемое администрацией британской зоны. Руководство СДПГ выступало за объединение с коммунистами и формирование единой общегерманской левой партии. Этот курс восторжествовал на Объединительном съезде КПГ и СДПГ в апреле 1946 г. Новая партия получила название Социалистической единой партии Германии (СЕПГ). Ее программа была ориентирована на решение насущных экономических проблем, «освобождение от эксплуатации и угнетения, нищеты, безработицы и империалистической военной угрозы», в перспективе – социалистическое строительство. Двумя равноправными председателями СЕПГ стали В. Пик и О. Гротеволь. Члены СДПГ, не поддержавшие программные установки единой рабочей партии, были исключены из ее рядов.