В среде молодежных экстремистских движений в конце 60-х гг. начали формироваться первые террористические группировки. Крупнейшей из них стала «Фракция Красной Армии» (РАФ). Она была образована в 1968 г. Анреасом Баадером и его единомышленниками, организовавшими поджог универмага во Франкфурте в знак протеста против действий полиции. РАФ провозгласила своей целью развязывание в стране пролетарской коммунистической революции. Идеологом РАФ стала журналистка Ульрика Майнхоф, автор нашумевшей книги «Концепция городской герильи». Она призывала использовать методы террора, чтобы заставить правящий режим проявить его «фашистскую сущность» и вывести трудящихся «из политической спячки». Еще одна известная левая террористическая группа была образована Фрицем Тойфелем в знак протеста против убийства полицейскими во время демонстрации 2 июня 1967 г. студента Б. Онезорга. Группа получила соответствующее название «Движение 2 июня» (Д-2). Тойфель пытался представить свою группу как представителя «трудового народа» и организовывал террористические акты и диверсии на производстве. Нередко левые радикалы прибегали и к индивидуальному террору.
В конце 60-х гг. в ФРГ возникает и праворадикальное движение, преимущественно националистического, неонацистского толка. Но первоначально правые экстремисты избегали террористических методов и пытались широко пропагандировать свои идеи. В 1964 г. была создана националистическая Национально-Демократическая партия Германии (НДПГ). За три года ее численность выросла до 40 тыс. человек. В 1967 г. НДПГ возглавил Адольф Тадден, поставивший цель преодолеть 5 %-ный барьер и образовать парламентскую фракцию. Легальные методы борьбы избрала и созданная в 1968 г. Германская коммунистическая партия (ГКП) под руководством Герберта Миса. Несмотря на небольшую численность (чуть более 20 тыс. человек), ГКП рассчитывала на союз с левыми молодежными группировками и политизацию профсоюзного движения.
Правительство пыталось противостоять подъему политического радикализма. Полиция жестко пресекала акции протеста, а в 1969 г. Кизингер внес на рассмотрение Бундестага «Закон о чрезвычайном положении». Помимо регламентации порядка ввода «чрезвычайного положения» и соответствующих полномочий правительства, этот закон обязал суды рассматривать дела по искам всех лиц, считающих неконституционными действия государственных властей на основании нарушения прав человека.
Социально-политический кризис конца 60-х гг. вызвал быстрое нарастание противоречий в «большой коалиции». Эта политическая комбинация была временной, и ее участники активно готовились к очередным парламентским выборам. Лидеры СДПГ уже продемонстрировали свою готовность внести глубокие коррективы в социально-экономический и внешнеполитический курс. Брандт активно использовал реформаторский имидж партии, призывая «сказать правду», покончить с косностью и консерватизмом. Свои амбиции подтвердила и СвДП, принявшая на съезде 1967 г. новую программу «107 тезисов». Свободные демократы в очередной раз поспешили дистанцироваться от крупнейших партий, заявив о пагубности как марксистской теории, так и «использования религии в политической борьбе». СвДП выступала в поддержку обновления внешней политики ФРГ, установления позитивных отношений с восточноевропейскими странами. В 1968 г. председателем СвДП был избран Вальтер Шеель, склонявшийся к сохранению партнерских отношений с СДПГ. Правая группировка Эриха Менде по-прежнему настаивала на сближении с христианскими демократами.
Руководство ХДС пыталось обновить идеологическую концепцию движения на принципах умеренности и прагматизма. Новая программа партии, принятая в 1967 г., опиралась на признание базовых принципов социального рыночного хозяйства, приоритета стабилизационной финансовой политики, охраны окружающей среды, протекционистской поддержки крестьян, а также развития «Объединенной Европы при сохранении Атлантического союза». Но вернуть политическую инициативу Кизингеру не удалось. Он не сумел также предотвратить заметное охлаждение в отношениях с ХСС. Амбициозный лидер христианских социалистов Штраус с трудом мирился с главенством Кизингера и часто демонстрировал самостоятельность. В 1968 г. ХСС принял новую программу, где подчеркивалась самобытность партии как в масштабе Баварии и Германии, так и Европы, приверженность ХСС идеям христианской традиции, приоритет связей с Францией и необходимость более равноправного партнерства с США.