В 1378 году церковь была расписана Феофаном Греком, выходцем из Византии. Ему же приписываются фрески церквей Федора Стратилата на Ручью и Успения на Болотове. Пострадавшая во время войны церковь Спаса Преображенья была восстановлена с частичной реставрацией в 1950 - 1951 годах.
Церковь Федора Стратилата, построенная на берегу засыпанного при послевоенной реконструкции Новгорода Федоровского ручья (по нему теперь проходит проспект Гагарина), - классический памятник новгородского зодчества второй половины XIV века. Ее нынешнее трехлопастное покрытие - результат реставрационных работ в послевоенное время. Фасад богато декорирован поясками треугольных впадинок, ароч-ками, нишками, тягами-валиками.
Неподалеку от церквей Федора Стратилата на Ручью и Спаса Преображенья была построена церковь Дмитрия Солунского. Характерная особенность ее декора - богатый орнамент из кирпичной кладки, внедренный в каменные стены.
За земляным валом на Рождественском кладбище, венчая холм, возвышающийся среди необозримой равнины, стоит небольшая церковь Рождества. Ее архитектурные формы просты и скромны. Здесь нет обильного декора, как в церквях Спаса Преображенья или Федора Стратилата. Внутри на верхних частях стен и сводах церкви сохранилась фресковая роспись, исполненная в 80-х годах XIV века. Вокруг церкви поднялся со временем культурный слой, который изменил пропорции памятника.
За земляным валом и речкой Виткой построен в XIV веке небольшой храм Иоанна Богослова. Церковь имела трехлопастное завершение, следы которого можно видеть на восточном фасаде. В XIV веке это покрытие было заменено восьмискатпым. В 1952 году памятник был восстановлен.
С середины XV века ведущая роль на Руси перешла к Москве. Часть новгородского боярства, стараясь сохранить свои феодальные привилегии, начала борьбу против прогрессивного стремления объединиться с Москвой. Правящая новгородская верхушка пригласила великого князя литовского и короля польского Казимира IV княжить в Новгород. Это привело к вооруженному столкновению между Москвой и новгородским боярством - с одной стороны и к обострению противоречий между боярством и новгородским ремесленно-торговым населением - с другой.
Московский князь Иван III в 1471 и 1478 годах совершил походы на Новгород и присоединил его к Московскому государству. Как символ своей победы он 15 января 1478 года увез новгородский вечевой колокол в Москву. С этого момента в истории Новгорода начался новый период, связанный с развитием Московского государства.
На первых порах Московскому государству пришлось встретиться с серьезной оппозицией новгородских бояр, стремившихся к возвращению былых порядков. Московское правительство вынуждено было принять репрессивные меры. В 1484, а затем в 1488 году из Новгорода были высланы тысячи бояр. На их место переселились жители Московской земли. В 1499 году отобранные у церквей и монастырей земли были переданы представителям московского служилого сословия. Все это; конечно, но могло не отразиться отрицательно на развитии новгородского зодчества.
Одним из крупнейших мероприятий правительства Московского государства явилась перестройка стен кремля «по старой основе». Началась она в 1484 году по указанию Ивана III и была связана с коренным переворотом в военном деле, вызванным развитием артиллерии. Закончена перестройка в 1490 году.
«Новгородская первая летопись» сообщает: «В лето 6998 (1490 г. - И. К.) поставлен бысть град каменной в Великом Новеграде повелением великого князя Иоанна Васильевича». Вполне вероятно, что в перестройке новгородского кремля принимал участие известный по работе в московском кремле Аристотель Фиораванте, бывший в то время в Новгороде.
Дошедшие до нашего времени стены и башни детинца являются в основном памятником московской фортификационной техники. Стены и башни (из 13-ти их осталось 9) выстроены из камня и кирпича. Длипа стон составляет 1385 метров, высота - от 8,5 до 10,6 метра, а толщина - 2,7 - 3,3 метра. Площадь, заключенная внутри степ, - более 12 гектаров. Башни кремля, выступающие наружу, предоставляли возможность вести фланговый огонь и хорошо простреливать пространство между ними.
Реконструкция стен и башен имела и большое градостроительное значение для Новгорода. Окончательно закрепилось положение детинца в плане города. А увеличение высоты стен и башен, их большая монументальность и величественность способствовали развитию живописного силуэта городского ансамбля.
На протяжении многих послевоеппых лот ведутся работы по реставрации стен и башен кремля по проекту архитектора А. Воробьева, которые должны воссоздать их облик конца XV столетия. Водь почти за пятисотлетнее существование стены и башни кремля значительно изменились в результате ремонтов и переделок.