Известны случаи столкновения адептов «Белого Братства» с последователями «Богородичного Центра», наиболее яркая провокационная акция произошла в Санкт-Петербурге, где в июне 1993 года проходил «Всероссийский покаянный собор» Богородичного центра. «Белые братья» пытались ворваться в зал, к алтарю и на сцену, где разыгрывалось музыкальное действо литургии, кричали:
В ноябре 1993 г. в Киеве едва не состоялось массовое самоубийство «белых братьев». Тогда же в Киеве адептами «Белого Братства» были устроены беспорядки. Страшный суд был запланирован на 24 октября 1993 года, затем был перенесен на более поздний срок, но, к счастью, грандиозного кровавого шоу с вознесением Марии Дэви, знаменующим начало Страшного суда не состоялось, оно было предотвращено в зачатке, хотя «белые братья» были однозначно настроены на смерть [1]. Кульминацией событий стал приход 10 ноября 1993 года 25 сектантов во главе с Цвигун и Кривоноговым в Софийский собор в Киеве. Милиция, усиленная сотрудниками ОМОНа «Беркут», прогнала их из храма и арестовала. Собору был нанесен ущерб в ценах 1993 г., по разным оценкам, от 50 млн. [11] до 69 млн. карбованцев [15]. Началось следствие по делу о «Белом Братстве», деятельность которого была приостановлена. Вскоре последовали сенсационные разоблачения о нанесении сектой ущерба душевному и физическому здоровью людей.
Украинская милиция задержала 616 человек, 137 объявили сухую голодовку в знак протеста против насилия [10]. 10.11.1993 г. задержаны руководители «Белого Братства».
Начались массовые выходы адептов из культа, хотя довольно большая часть их все же осталась. Юсмалиане продолжают печатать и распространять свою газету «Юсмалос», раздают так называемые листовки – «христовочки», аудио– и видеокассеты с записями речей и стихов Цвигун, занялись написанием протестов в разного рода общественные организации, в том числе и зарубежные, с требованиями освобождения Цвигун.
Почти сразу после событий в Киеве, в 1993-1994 гг. Цвигун провела корректирование доктрины «Белого Братства» с целью недопущения потери влияния на своих адептов. Цвигун тогда разорвала брачные узы с Кривоноговым и списала на него все негативное, все грехи братства.
Марина Цвигун была осуждена Киевским городским судом приговором от 9 февраля 1996 г. по статьям 187-5, 209, 101-ч.1 УК Украины к четырем годам лишения свободы в ИТК общего режима. До суда М.Цвигун содержалась в СИЗО-1 УВД Киевской обл. Суд длился 9 месяцев.
Следует отметить, что в отношении самого Кривоногова уголовное дело было возбуждено еще в 1992 г. [15].
Этим же приговором суда В.В.Ковальчук был осужден на шесть лет усиленного режима, а Ю.А.Кривоногов – на семь лет усиленного режима [6].
Однако киевский прокурор С.В. Лотюк опротестовал этот приговор, считая его слишком мягким для повышенно общественно-опасного лица, каким стала для общества Марина Цвигун. Осенью 1996 года на Украине проводилась амнистия, под которую подпадала Цвигун, как мать несовершеннолетнего ребенка, однако в амнистии ей было отказано, так как к тому времени он достиг 16 лет. Она подавала кассационную жалобу, обращалась через местных «правозащитников» к Генпрокурору Украины и даже в Международный Суд Совета Европы в Страсбурге.