Опасность мощной русской минной контратаки привела к тому, что в начале декабря 1904 г. японцы решили изменить тактику действий. Они решили «выкурить» наших минеров из подземелья, а затем по захваченным галереям атаковать гарнизон форта. Для этого японцы в галереях подожгли войлок и мешки, наполненные составом, дающим при сгорании удушливые газы. Но наши специалисты уже имели опыт борьбы с «газовыми» атаками врага и своевременно предприняли необходимые меры. Саперы в некоторых местах перекрыли мешками галерею, а в казематах обеспечили свободный доступ свежего воздуха. Такие меры позволили существенно снизить концентрацию газов и воздействие отравляющих веществ. Поэтому очередная «газовая атака» противника не принесла особого вреда обороняющимся.
Видя невысокую эффективность такого рода отравляющих веществ, японцы пустили в дело состав, содержавший мышьяк. В результате многие наши солдаты и офицеры отравились, потеряли сознание и были госпитализированы. Но форт не сдавался, борьба в галереях продолжалась.
Тогда японцы снова сделали ставку на минную атаку. Они вывели под бруствер две галереи, на концах которых было установлено 8 горнов. Общая масса зарядов равнялась 140 пудам пороха. Спецкоманда неприятеля заминировала бруствер форта и подготовила его к уничтожению. С русской стороны требовались срочные контрмеры. Но вырытые буле-вые колодцы командование форта никак не решалось зарядить и подорвать галереи неприятеля. В конце концов, генерал Горбатовский 4 декабря отдал приказ на проведение минной контратаки вечером следующего дня. Но было уже поздно.
Противник опередил русских минеров. 5 декабря в 13 часов 45 минут раздался оглушительный взрыв, от которого вздрогнул весь форт. В небо взметнулся огромный столб дыма, земли, обломков и др. Сразу после взрыва группа японцев в 40 — 50 человек бросилась в атаку, но была отбита ружейным и пулеметным огнем уцелевших бойцов.
Через несколько минут рядом раздался новый взрыв, и в небо поднялся еще один столб пыли и дыма в форме темной тучи. Снова японцы устремились к нашим позициям и в очередной раз успеха не имели. Более того, от третьего взрыва, который последовал сразу за вторым, погибла группа атаковавших японцев. После того, как осели клубы пыли и дыма, оказалось, что почти весь напольный бруствер разрушен на протяжении 10 сажень, а в центральной части образовалась огромная воронка. Правая сторона форта пострадала гораздо меньше — бруствер лишь слегла осел.
Поначалу среди русских солдат возникла паника, но офицеры быстро восстановили порядок, и все атаки противника были отбиты. Хотя силы были неравными, и защитникам форта приходилось нелегко, тем не менее, никто не собирался сдаваться, и воинский дух защитников крепости был высок.
Вот что писал подполковник крепостной артиллерии Трентовиус в середине декабря 1904 г.: «Потерь у нас очень много — 1/3 офицеров всего гарнизона убита, причем половина состава ранены, между ними есть офицеры, имеющие по несколько ран, и все-таки оставшиеся в строю. Нижних чинов убито, ранено и умерло от болезней около 2/3 всего состава и едва ли наберется в Порт-Артуре 15 000 штыков. У нас свирепствует цинга, все свободные дома заняты лазаретами и околотками. Японская артиллерия сильно разрушает наши форты и укрепления; от выстрела из 11-ти дюйм, мортиры ничто не может устоять, солдаты только ее и боятся, а на остальные выстрелы не обращают никакого внимания. Из 6-ти фортов обороняющих Порт-Артур, японцами взят только один № II на правом фланге и то имиРке предварительно взорван. Больших штурмов японцы не предпринимают, а подходят тихой сапой и стараются подкопами взрывать укрепления, как им это и удалось на форту № II. Такой способ овладения Порт-Артуром потребует слишком много времени, и мы надеемся, что к нам подоспеет помощь, прежде чем японцы возьмут Порт-Артур... Ждем в конце января наш Балтийский флот и на него теперь возлагаем все наши надежды, быть может, он подвезет нам боевых припасов и продовольствия и откроет сообщение с г. Чифу, откуда все можно достать. Генерала Куропаткина мы уже перестали ожидать... Полевая артиллерия обратилась в крепостную, так как всех лошадей передали для убоя в интендантство. При всем этом, мы, Артурцы, не горюем и твердо убеждены, что будем спасены и освобождены; японцам же еще долго и много придется уложить людей, чтобы взять Порт-Артур».
15 декабря роковая случайность унесла из жизни душу обороны Порт-Артура — генерала Кондратенко Р. И. В этот день генерал прибыл на форт II для поднятия духа и вручения наград героям. 275-мм снаряд угодил в группу офицеров прямо во время торжественного вручения ордена. Тут же погибли командующий стрелковым полком подполковник Науменко и комендант форта инженер-подполковник Рашевский. Обороне Порт-Артура был нанесен невосполнимый урон.
Командующий японской осадной армией под Порт-Артуром генерал Ноги
16 декабря японцы снова попытались атаковать форт II, но их атака в очередной раз была отбита. Тогда Фок уменьшил гарнизон форта, что создало предпосылку его захвата врагом.