В феврале Франциск положил начало уже радикальным изменениям в финансовой системе, направленным на унификацию и ужесточение контроля за бюджетом всех служб Св. Престола и Ватикана. Он перестроил систему управления курии, создав новый орган — Секретариат по делам экономики,
которому была передана большая часть функций Администрации наследия Св. Престола, выступающей теперь в роли казначейства Св. Престола и Града Ватикан и одновременно в роли центрального банка, главной миссией которого должно быть поддержание связей с другими центробанками (как того требует Moneyval)[935]. Секретариат по делам экономики взял на себя финансовое планирование, составление бюджета и управление всеми видами экономических активов Св. Престола и Ватикана в соответствии с современными методами и стандартами бухгалтерского учёта. Префектом Секретариата, подотчётным лично папе, стал член «Совета-9» архиепископ Сиднея кардинал Джордж Пелл, должность которого стала второй по значению после госсекретаря. А генеральным секретарём Секретариата стал мальтийский куриальный прелат Альфред Ксерб, бывший с марта 2013 года по март 2014 года личным секретарём Франциска.Для контроля за деятельностью Секретариата и установления руководящих принципов его политики был создан Совет по экономическим делам. В него вошли 8 клириков и 7 мирян с большим финансовым опытом, а координатором его стал также член «Совета-9» архиепископ Мюнхена и Фрайзинга кардинал Рейнхард Маркс.
Кроме этого была введена должность генерального ревизора (аудитора), назначаемого понтификом и имеющего право в любое время проводить проверку любого органа Св. Престола и Ватикана.В июне 2014 года в целях более эффективного контроля за ИДР был полностью сменён состав Совета директоров Управления финансовой информации (УФИ), назначенных Бенедиктом XVI, срок полномочий которых истекал только в 2016 году. Вместо 5 итальянцев в него вошли 4 эксперта из разных стран мира. Среди них — профессор Гарвардского университета, бывший сотрудник финансовой разведки США, специалист по борьбе с терроризмом, автор доктрины «финансовой войны» Хуан Сарате,
работавший с американским президентом Дж. Бушем-младшим; банковский топ-менеджер J.P. Morgan and Merrill Lynch и член Мальтийского ордена швейцарец Марк Одендаль; бывший глава Банка развития Сингапура Джозеф Юварадж Пиллай, кстати, считающий индуистскую «Бхагавад-гиту» идеальным пособием по менеджменту[936]. Директором УФИ впервые была поставлена женщина — итальянка Мария Бьянка Фарина, возглавлявшая страховое подразделение итальянской почтовой службы Poste Vita. А президентом Управления стал его бывший директор, всё тот же «Джеймс Бонд финансового мира» Рене Брюлхарт. Как заявил Брюлхарт в своём интервью, УФИ проделал большую работу, став членом группы «Эдмонд» и подписав многочисленные конвенции по сотрудничеству с США, Германией, Францией и Италией.В июле 2014 года по указанию папы произошла смена руководства уже и самого Банка Ватикана — после того, как прошедшая проверка выявила, в частности, не отражённые в документах активы на сумму более 1 миллиарда евро. Во главе него был поставлен французский финансист Жан-Батист де Франсу,
ранее возглавлявший инвестиционную компанию Шуевсо и Европейскую ассоциацию по управлению фондами и активами. Как заявил префект Секретариата по экономическим вопросам кардинал Г. Пелл, новое руководство переходит ко второй стадии реформы Банка, чтобы «стать образцом в области финансового управления»[937]. ИДР должен перестать заниматься инвестиционными операциями и будет обеспечивать только операции по оплате и финансовые консультации для монашеских орденов, благотворительных организаций и сотрудников Ватикана.