С конца апреля 1994 г. основные бои развернулись на юге Тертерского и на севере Агдамского районов. 26 апреля 1994 г., после нескольких дней тяжелых боев, армянскими войсками были захвачены села Сумы, Тагибейли Агдамского района. Таким образом, армянские войска вышли в тыл сел Баш Карвенд, Шыхлар и Джавахирли Агдамского района. В ночь с 27 на 28 апреля 1994 г. азербайджанские войска оставили эти села. 30 апреля 1994 г. армянскими войсками были захвачены села Намирли, Шураабад, Шотланы и Ярымджа Агдамского района. Таким образом, армянским войскам удалось пробить существенную брешь в обороне азербайджанских войск на севере Агдамского района и, двигаясь вдоль дороги Агдам – Барда, выйти к границе Агдамского и Бардинского районов. С целью остановки армянского наступления в зону боевых действий были переброшены 777-й МСП под командованием Ровшана Акперова, полк внутренних войск под командованием Фатуллы Гусейнова, 888-я МСБР под командованием Фирудина Шабанова, 701-я МСБР под командованием Яшара Айдамирова, а также другие дополнительные силы.
Азербайджанские войска заняли оборону по линии Ахмедагалы – Мирашелли – Орта Карвенд – Тазакенд – Кайнаг – Казйан. Основной задачей стало удержать линию Мирашелли – Тазакенд, чтобы не дать армянским войскам продвинуться вдоль дороги Агдам – Барада и выйти к перекрестку «Четыре дороги». С этой целью из имевшихся в наличии сил 190-й бригады и подошедших резервов была сформирована ударная группа и 2 мая 1994 г. был нанесен встречный контрудар по наступающим армянским войскам. В результате контрудара удалось задержать наступление армянских войск и освободить села Шыхлар, Намирли и Шураабад. За эти села несколько дней шли бои, после чего 7 мая 1994 г. эти села вновь перешли под контроль армянских войск. Азербайджанские войска заняли оборону около этих сел. Надо отметить, что хотя контрудар азербайджанских войск не изменил коренным образом обстановку на фронте и не восстановил утраченное оперативное положение, он позволил сковать силы противника и остановить его дальнейшее продвижение до подтягивания необходимых резервов и закрытия брешей в обороне, образовавшихся после прорыва армянских войск по линии Гюллюджа – Баш Карвенд.
Одновременно развернулись ожесточенные бои на юге Тертерского района. Основной удар армянских сил наносился на село Капанлы с целью захвата села и обхода Тертера с юга. Им удалось захватить села Кармираван и Сейсулан, после чего начались ожесточенные бои за село Капанлы. Оборону на этом направлении держали бойцы 776-го отдельного разведывательного отряда, 777-го МСП и 703-й МСБ. 2–5 мая 1994 г. за село Капанлы шли ожесточенные бои, противнику даже удалось ворваться в село. Однако контрударом азербайджанские войска (777-й МСП, 776-й отдельный разведывательный отряд и подразделения 703-й МСБР) выбили армян из села. Попытки армянских войск расширить прорыв в южном направлении не удались, их атаки на села Ахмедагалы и Мирашелли были отбиты. 2 мая 1994 г. армянские войска из дальнобойной артиллерии обстреляли город Барду.
4–5 мая 1994 г. в Бишкеке прошли переговоры между Азербайджаном и Арменией. По итогам переговоров было подготовлено соглашение о перемирии, получившее название Бишкекский протокол. Данный протокол был подписан председателем парламента Армении Б. Аракцяном и «и.о. председателя Верховного Совета НКР» К. Бабуряном. Но азербайджанская делегация отказалась подписать данное соглашение и вернулась в Баку.
7 мая 1994 г. спецпредставитель президента РФ по Карабаху В. Казимиров прибыл в Баку, где продолжил переговоры о подписании данного соглашения.
8 мая 1994 г. в Баку председатель Верховного Совета Расул Гулиев подписал Бишкекский протокол о прекращении боевых действий. Как вспоминал Расул Гулиев, он только что вернулся с передовой в Тертере, где лично убедился в том, что азербайджанские позиции находятся в критическом положении. Это убедило его в том, что Азербайджану необходимо прекращение огня[173]
. Также перед подписанием Бишкекского протокола 5–7 мая 1994 г. Гейдар Алиев выехал с визитом в Брюссель и Анкару, где провел многочисленные переговоры с западными и турецкими политиками. Видимо, поняв, что Азербайджану не придется рассчитывать на поддержку западных стран в случае продолжения войны, им и было принято решение о подписании соглашения о прекращении боевых действий.После подписания Бишкекского протокола было подготовлено соглашение о прекращении боевых действий с 00 часов 01 минуты 12 мая 1994 г. 9 мая 1994 г. его первым подписал министр обороны Азербайджана Мамедрафи Мамедов. 10 мая 1994 г. подписал министр обороны Армении Серж Саркисян. 11 мая 1994 г. подписал командующий армянскими войсками в Нагорном Карабахе Самвел Бабаян.