4 июня вечером, чтобы сузить линию обороны перед многократно превосходящей 709-ю ОМСБР группировкой, сосредоточенной в Гёранбойском районе, командование вывело 709-ю ОМСБР на сопки между Гянджой и Гёранбоем.
5 июня 1993 г. под руководством президента Эльчибея было проведено совместное совещание правительства НФА, армейского командования и руководства НФА. На этом совещании обсуждался вопрос о продолжении карательной операции в Гяндже с привлечением дополнительных сил, в том числе и с участием ВВС. Начальник генштаба генерал-майор Нуреддин Садыхов выступил против втягивания армии во внутриполитические разборки, за что был освобождён от занимаемой должности и на его место был назначен полковник Сафар Абиев. С протестом против втягивания армии во внутриполитические разборки выступил и министр обороны Дадаш Рзаев. На этом совещании должность министра обороны была предложена генерал-майору Наджмеддину Садыхову с условием, что он организует и проведет новую карательную операцию в Гяндже. Но генерал Наджмеддин Садыхов отказался участвовать в этой авантюре. В связи с отказом многих подразделений вооружённых сил от участия в карательной операции было принято решение о направлении к Гяндже в том числе и подразделений погранвойск и муниципальной полиции. Всего к Гяндже было переброшено более трёх тысяч дополнительных сил[188]
.Несколько дней вокруг Гянджи продолжалось противостояние правительственных войск и подразделений 709-й бригады. По приказу правительства с фронта были сняты подразделения и направлены к Гяндже для окружения и блокирования города. Но ситуация уже шла по негативному для правительства НФА сценарию. Большинство подразделений отказывались от участия в новой карательной операции в Гяндже. Многие войска переходили на сторону Сурета Гусейнова. В ходе переговоров между лояльными Сурету Гусейнову войсками и войсками, переброшенными к Гяндже по приказу правительства НФА, была достигнута договорённость о нейтралитете многих подразделений, часть перешла на сторону Сурета Гусейнова, часть, передав своё вооружение 709-й ОМСБР, ушла от Гянджи.
Учитывая неразбериху в политическом и военном руководстве страны, наличие различных политических центров со своими приближенными силовыми структурами и вооруженными отрядами, близкими к власти и неконтролируемыми президентом Абульфазом Эльчибеем, и чтобы окончательно остудить горячие головы от НФА и упредить новые попытки силового решения кризиса, части 709-й бригады начали 10 июня 1993 г., не встречая никакого сопротивления, продвижение на восток в направлении Баку.
12 июня 1993 г. у Евлаха начавшие движение на Баку подразделения 709-й бригады разделились на две части: первая группа двигалась на Баку по южной Кюрдамирской дороге, а вторая группа по северной Ахсуинской дороге. Группы двигались окружными дорогами, не въезжая в райцентры. К 15 июня 1993 г. первая группа подошла к н/п Наваи, а вторая группа к н/п Джейранкечмез Гобустанского района.
В правительстве НФА в это время царила паника. Вот как описывает эти события советник посольства Турции в Азербайджане Тургут Эр: «Мы с друзьями находились в кабинете министра обороны Дадаша Рзаева. Министр сказал: «Никто с места не двигается. Сопротивление народа сломлено. Ни один солдат не подчиняется приказу». Эльчибей позвонил в турецкое посольство, чтобы попросить вмешаться 100 турецких военных, которые в Насосном проводили обучение азербайджанских солдат. Но на его звонки никто не ответил. В это время турецкий военный по имени Касиф Казыноглы проводил обучение в полку охраны президента. Он позвонил нам в кабинет министра обороны и сказал: «Брат, что вы там делаете? Немедленно уходите оттуда и возвращайтесь в гостиницу». Так мы поняли, что Турция больше не поддерживает Эльчибея»[189]
. На коллегии министрества обороны 15 июня 1993 г. было принято решение, что армия не будет вмешиваться во внутриполитчиеские разборки. В своем выступлении заместитель министра внутренних дел полковник Ровшан Джавадов заявил, что в Гяндже произошло восстание народа против беззакония и несправедливости, а Сурет Гусейнов фактически является лидером народного движения.[190] Для защиты своей власти правительство НФА перебросило из Нахичевани два батальона НФА.16 июня 1993 г. около н/п Наваи произошли столкновения частей 709-й бригады и «батальонов НФА», в ходе которых имелись погибшие и раненые. В ночь на 17 июня 1993 г. президент и Верховный главнокомандующий Вооружёнными силами Азербайджана Абульфаз Эльчибей сбежал из Баку в своё родное село Келеки в Нахичевани.
После бегства из Баку президента Эльчибея первая группа 709-й бригады подошла к пос. Шихов в 10–15 км от Баку, а вторая группа дошла до пос. Хырдалан в 15–20 км от Баку. Простояв там несколько дней, 22–23 июня 1993 г. обе группы вернулись обратно в Гянджу.