На следующий день, 13 февраля 1993 г., утром Сурет Гусейнов в здании Министерства внутренних дел встретился с министром Искандером Гамидовым и заместителем министра Ровшаном Джавадовым. Оба в разговоре высказали своё несогласие с заявлением исполкома НФА. Потом Сурет Гусейнов приехал в администрацию президента, снова встретился с Панахом Гусейновым, где они обсудили его отставку с должности командира корпуса и назначение руководителем концерна «Азершерсть». Панах Гусейнов сказал, что указ ещё не готов и пусть Сурет Гусейнов едет домой, пока они подготовят указ. Когда Сурет Гусейнов из администрации президента поехал в квартиру к родственникам, около дома была попытка его ареста. Перепутав, сотрудники полиции арестовали его родственников. Сумев избежать ареста, Сурет Гусейнов срочно покинул Баку и ночью добрался до штаба корпуса, откуда позвонил президенту Абульфазу Эльчибею, высказал ему своё неудовольствие произошедшим и потребовал освобождения арестованных родственников.
В этот же день указом президента Сурет Гусейнов был отстранён от командования 2-го АК на время расследования. С учетом того, что начальник штаба корпуса Ильхам Асланов был тяжело ранен и находился в госпитале, после отстранения Сурета Гусейнова от должности комкора 2-й АК фактически остался без командования.
Через несколько дней в президентском аппарате прошло расширенное заседание с участием руководителей силовых структур. На этом совещании с резкой критикой против руководства Минобороны и Сурета Гусейнова выступили министр внутренних дел Искендер Гамидов, госсоветник Ариф Гаджиев, министр иностранных дел Тофик Гасымов, которые обвинили Сурета Гусейнова в преднамеренном выводе войск, в том, что в Минобороны бардак, руководство Минобороны не справляется со своими обязанностями. Первый замминистра национальной безопасности Сульхеддин Акперов обвинил руководство Минобороны в подготовке секретных групп для переворота. В качестве доказательства им была приведена концепция Минобороны о создании секретных диверсионных групп (данная концепция была подготовлена замминистра обороны Аликрамом Гумбатовым), которые должны были быть переброшены в Нагорный Карабах в тыл противника. Для подготовки этих групп в различных регионах Азербайджана были секретные центры (лес Пиргулу, полигон Истису в Астаринском районе и т. д.), в эти центры были собраны лица, владеющие армянским языком, которые проходили спецподготовку. Руководителем данной секретной операции был назначен замминистра обороны Аликрам Гумбатов. Со слов Сульхеддина Акперова, эти группы готовились для свержения власти.
19 февраля 1993 г. было проведено закрытое заседание Милли Меджлиса, на котором обсуждалось положение в Азербайджане и на фронте. На это заседание были приглашены министр обороны Рагим Газиев, заместители министра обороны Аликрам Гумбатов и Вахид Мусаев. На этом заседании со стороны власти руководство Минобороны было обвинено в неспособности вести войну, а министр обороны – в связях с российскими военными (были оглашены телефонные переговоры Рагима Газиева с командованием 104-й ВДД) и в подготовке свержения власти совместно с российскими военными. После этих обвинений Рагим Газиев вышел на трибуну и заявил о том, что подаёт в отставку.
20 февраля 1993 г. указом президента Р. Газиев был освобождён от должности министра обороны, на его место министром обороны был назначен генерал-майор Дадаш Рзаев, который до этого командовал 1-й АК.